尼氏真綏螨性別決定相關(guān)基因的研究.pdf_第1頁(yè)
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1、昆蟲和高等動(dòng)物都已發(fā)現(xiàn)參與個(gè)體發(fā)育的Sox與Dmrt基因家族,這兩個(gè)基因家族在進(jìn)化上高度保守。Dmrt基因家族與性別決定相關(guān),該家族成員都含有一個(gè)具有DNA結(jié)合能力的保守基序―DM結(jié)構(gòu)域,以鋅指結(jié)構(gòu)與特異DNA序列結(jié)合,在性別決定和分化發(fā)育的調(diào)控中擔(dān)負(fù)著重要的功能。Sox家族成員的典型特征是編碼的蛋白質(zhì)都具有一個(gè)保守的基序HMG-box,可以與DNA序列特異性結(jié)合,促進(jìn)基因的特異轉(zhuǎn)錄,從而在胚胎發(fā)育及性別分化中起著重要的調(diào)控作用。

2、>  本文采用簡(jiǎn)并PCR技術(shù),對(duì)尼氏真綏螨Sox基因的保守序列和Dmrt基因的DM結(jié)構(gòu)域進(jìn)行了擴(kuò)增、克隆和測(cè)序,并將序列與GenBank中其他物種的相應(yīng)序列進(jìn)行同源性比較;用Swiss-model軟件模擬編碼氨基酸三維結(jié)構(gòu),用MEGA4.0和ClustalW2等軟件構(gòu)建系統(tǒng)樹和分析了不同物種間Sox基因的保守序列和Dmrt基因的DM結(jié)構(gòu)域的進(jìn)化關(guān)系。
  從尼氏真綏螨篩選克隆到4個(gè)Dmrt基因家族成員的DM結(jié)構(gòu)域,按通用命名法,根

3、據(jù)尼氏真綏螨的拉丁名Euseiusnicholsi,分別命名為EnDmrt2a,EnDmrt2b,EnDmrt2c,EnDmrt2d,它們與人DmrtA1、DmrtA2、DmrtA2、DmrtA1保守區(qū)的核苷酸的相似性分別為77%、76%、77%、72%,與人DmrtA2氨基酸序列的一致性分別為95%,95%,95%,91%;它們與人DmrtA2編碼的氨基酸三維模型間沒(méi)有明顯的變化;與人、獼猴、黃牛、鼠、褐牙鲆、太平洋牡蠣、大型蚤、果蠅

4、、線蟲等9個(gè)物種Dmrt基因DM結(jié)構(gòu)域編碼的氨基酸構(gòu)建的分子進(jìn)化樹表明,EnDmrt2a、EnDmrt2b、EnDmrt2和大型蚤聚為一類,與人等其他動(dòng)物的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),EnDmrt2d與所有動(dòng)物的親緣關(guān)系都遠(yuǎn)。
  從尼氏植綏螨克隆得到了Sox基因HMG-box克隆,命名為EnSox1a。EnSox1a的核苷酸序列及其編碼氨基酸與其它無(wú)脊椎動(dòng)物和脊椎動(dòng)物物種的相似性分別達(dá)到74%-77%和85%-95%。與蜱、紅原雞、非洲爪蟾、

5、文昌魚、人、鼠、無(wú)腸蟲、野豬、貓等9種動(dòng)物Sox基因的HMG-box編碼氨基酸序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)發(fā)育樹表明,EnSox1a單獨(dú)聚為一類,與其他物種的近緣關(guān)系較遠(yuǎn)。用EnSox1a、人Sox1和非洲爪蟾Sox2三者編碼氨基酸序列建立的三維結(jié)構(gòu)模型沒(méi)有幾乎沒(méi)有差異,說(shuō)明不同物種Sox基因HMG-box具有功能上的相似性。
  本研究結(jié)果顯示,在尼氏真綏螨基因組中存在著Sox和Dmrt基因家族的多個(gè)成員;與其他動(dòng)物Sox和Dmrt基因的

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