復(fù)雜生物性狀局部基因網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建方法的研究.pdf

1、本課題的研究目的是構(gòu)建出復(fù)雜生物性狀的局部基因網(wǎng)絡(luò)模式，并且運用構(gòu)建的局部基因網(wǎng)絡(luò)模式作為分析復(fù)雜生物性狀分子機制的手段。選取高血壓、長壽和胚胎干細(xì)胞的敏感基因作為研究對象，搜集并整合大量生物信號通路等基因相關(guān)信息，使用KEGG數(shù)據(jù)庫提供的KGML圖解基因網(wǎng)絡(luò)編輯器和Osprey軟件，對這四種復(fù)雜生物性狀的敏感基因之間的關(guān)聯(lián)性做了初步分析，得到以下結(jié)論：
　　 1.構(gòu)建的高血壓局部基因網(wǎng)絡(luò)模式，包含22條信號通路作為連線，15個

2、基因作為節(jié)點，建立了64種連接方式的局部基因網(wǎng)絡(luò)模式。隨機選擇其中的一種連接方式，構(gòu)畫出了一張包含47個基因、9條信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的高血壓局部基因網(wǎng)絡(luò)圖，其中，MAPK signaling pathway，Purine metabolism，Calcium signaling pathway和Adipocytokine signaling pathway分別控制多糖代謝、葡萄糖代謝和游離脂肪酸的代謝。
　　 2.應(yīng)用基因芯片技術(shù)分析

3、得出，LEPR、PLC、NCX基因表達(dá)值上調(diào)與GLUT1、VEGF、GPCR、GS、PKG、RAP1A、AKT、PRKAR2B、ADA、AMPK、AGT、GUCY基因的表達(dá)值下調(diào)。
　　 3.構(gòu)建出人類長壽局部基因網(wǎng)絡(luò)模式包含223種連接方式，19條信號通路，8個人類長壽基因，5個連接基因和一個化合物(c00097)，以一種連接方式為依據(jù)得到人類長壽局部基因網(wǎng)絡(luò)圖，包含17個基因和2個化合物。
　　 4.建立了線蟲長壽基