關(guān)聯(lián)技術(shù)挖掘基因相互作用關(guān)系的研究.pdf_第1頁(yè)
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1、一次微陣列實(shí)驗(yàn)可同時(shí)觀測(cè)成千上萬(wàn)基因的表達(dá)值,得到含有豐富生物信息的高維DNA微陣列基因表達(dá)數(shù)據(jù)。通過(guò)分析這些高通量數(shù)據(jù)中基因表達(dá)數(shù)據(jù)的關(guān)聯(lián)性,有助于研究未知基因的功能分類(lèi),推測(cè)基因間的相互作用關(guān)系,尋找共表達(dá)的基因類(lèi),預(yù)測(cè)基因的調(diào)控模式,根據(jù)基因間共調(diào)控或共表達(dá)關(guān)系構(gòu)建基因相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。
  論文以基因芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)為數(shù)據(jù)源,采用統(tǒng)計(jì)學(xué)中的相關(guān)性理論,研究相關(guān)基因的相互作用關(guān)系,主要開(kāi)展了以下工作:
  1.對(duì)照轉(zhuǎn)錄因

2、子對(duì)基因的調(diào)控關(guān)系表,篩選出受轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的大腸桿菌操縱子,對(duì)篩選出的操縱子基因表達(dá)數(shù)據(jù)分別作皮爾遜相關(guān)性度量和斯皮爾曼秩相關(guān)性度量。研究結(jié)果表明,86.33%的操縱子內(nèi)基因的皮爾遜相關(guān)系數(shù)在0.5-1之間分布,在p<0.01的水平上呈顯著性相關(guān);84.53%的操縱子內(nèi)基因的斯皮爾曼秩相關(guān)系數(shù)分布在0.5-1之間,在p<0.01的水平上呈顯著性相關(guān)。這些結(jié)果在高通量數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)方面為操縱子預(yù)測(cè)提供了基因組信息,對(duì)操縱子的預(yù)測(cè)具有重要意義。<

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