基于融合特征的蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測.pdf

1、隨著人類基因組計(jì)劃的順利完成，越來越多的DNA序列和蛋白質(zhì)序列被測定出來，單純的生物實(shí)驗(yàn)已經(jīng)無法填補(bǔ)大量序列信息與嚴(yán)重不足的蛋白質(zhì)功能注釋之間的空隙，而且既耗時(shí)，成本又高，所以迫切的需要通過計(jì)算的方法來預(yù)測蛋白質(zhì)功能。然而，另有生物學(xué)研究表明，蛋白質(zhì)功能與蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位是密切相關(guān)的，蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位信息可以為蛋白質(zhì)功能的研究提供有用的線索。因此為了進(jìn)一步了解蛋白質(zhì)的功能，識(shí)別蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位成為了蛋白質(zhì)組學(xué)的一個(gè)重要研究方向。

2、>　　本文主要圍繞這一主題，針對蛋白質(zhì)序列的編碼方法和分類預(yù)測算法兩方面進(jìn)行了研究，并在不同的數(shù)據(jù)集上分別進(jìn)行了測試和分析。本文的主要?jiǎng)?chuàng)新工作概括如下：
　　本文提出了一種新的蛋白質(zhì)序列編碼方法，該方法由三個(gè)序列特征融合而成，第一個(gè)序列特征為傳統(tǒng)的20維的氨基酸基本組成，第二個(gè)序列特征為氨基酸位置信息，主要提取了每個(gè)氨基酸殘基在序列中的位置信息，第三個(gè)序列特征為氨基酸局部順序信息，我們將每個(gè)氨基酸殘基用五位ASCII碼表示，那么每