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1、STR分型技術(shù)自20世紀(jì)90年代起就備受法醫(yī)物證研究者的關(guān)注,是目前進(jìn)行親權(quán)鑒定采用的最主要的技術(shù)手段。
隨著STR基因座在親權(quán)鑒定中的廣泛應(yīng)用,觀察到越來(lái)越多STR基因座發(fā)生突變的現(xiàn)象,對(duì)親權(quán)鑒定的結(jié)果評(píng)判造成很大的影響。隨著鑒定技術(shù)的成熟和社會(huì)的需求,親權(quán)鑒定的范圍已從三聯(lián)體(父-母-子)和單親(父-子或母-子)鑒定擴(kuò)展到同胞、祖孫、叔侄等各種隔代和旁系親緣關(guān)系的鑒定。其中,同胞(包括同父同母的全同胞關(guān)系和同父異母或同
2、母異父的半同胞關(guān)系)鑒定最為常見(jiàn)。為了科學(xué)、準(zhǔn)確、高效地進(jìn)行親權(quán)鑒定案件的分析,本文針對(duì)常染色體STR基因座突變和同胞鑒定這兩類常見(jiàn)的疑難親權(quán)鑒定案件,就以下三個(gè)方面開(kāi)展了研究:
1.STR突變的親權(quán)鑒定案件的分析
本文對(duì)8122個(gè)家系進(jìn)行調(diào)查,觀察24個(gè)常用STR基因座等位基因突變的現(xiàn)象及特點(diǎn)。結(jié)果在PowerPlexTM16體系的15個(gè)STR基因座中,發(fā)現(xiàn)274個(gè)家系的285次突變事件,在STRTtype
3、rTM10體系的9個(gè)STR基因座中,發(fā)現(xiàn)17個(gè)家系的17次突變事件。
分析突變事件發(fā)現(xiàn),PowerPlexTM 16體系的15個(gè)STR基因座突變率介于0.0070%~0.2592%之間,而在STRTyperTM10體系的9個(gè)STR基因座中,D6S1043的突變率最高,為0.4357%,D22-GATA198B05尚未觀察到突變事件。各基因座的突變率存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。PowerPlexTM16體系基因座的突變率與其他群體比較存
4、在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。
比較基因座的最大同一連續(xù)重復(fù)次數(shù)幾何均數(shù)與突變率的對(duì)數(shù)值,結(jié)果發(fā)現(xiàn),隨著幾何均數(shù)的增加,突變率也增加。
突變模式符合逐步突變模式,突變事件中存在性別的差異,男性較女性常見(jiàn)。增加重復(fù)單位、減少重復(fù)單位及不能確定增加或減少者之間具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
根據(jù)Fimmers法、Brenner法及Ayres法的原理推導(dǎo)歸納出各類突變案件的計(jì)算公式。比較各種分析方法,結(jié)果顯示Brenner法在判斷
5、存在突變基因座的親權(quán)鑒定案件中較為合適。運(yùn)用Brenner法分析發(fā)現(xiàn),存在突變基因座而肯定父權(quán)關(guān)系的三聯(lián)體親權(quán)鑒定在PowerPlexTM16體系中的PI值多數(shù)在10000~100000之間,且PI值成正態(tài)分布。
2.STR分型進(jìn)行同胞關(guān)系親緣鑒定案件的分析
采用三種分析方法分別計(jì)算1247例全同胞關(guān)系鑒定案例、193例半同胞關(guān)系鑒定案例和1430對(duì)無(wú)關(guān)個(gè)體15個(gè)基因座和24個(gè)基因座檢測(cè)的SI值發(fā)現(xiàn),ITO法
6、的效能較Ayres法和IBS法高,ITO法與Ayres法的相關(guān)性較與IBS的好,效能與相關(guān)性隨著檢測(cè)基因座數(shù)目的增加而增加。
根據(jù)ITO法計(jì)算的同胞親權(quán)指數(shù)比較,得出各臨界值作為判定標(biāo)準(zhǔn)的各項(xiàng)統(tǒng)計(jì)指標(biāo),并提出在檢測(cè)PowerPlexTM16體系15個(gè)基因座時(shí),以FSI≧3作為判定全同胞與無(wú)關(guān)個(gè)體的標(biāo)準(zhǔn);以HSI≧1作為判定半同胞與無(wú)關(guān)個(gè)體的標(biāo)準(zhǔn)。在檢測(cè)PowerPlexTM16和STRTyperTM10體系24個(gè)基因座時(shí),
7、以FSI≧10作為判定全同胞與無(wú)關(guān)個(gè)體的標(biāo)準(zhǔn);以HSI≧3作為判定半同胞與無(wú)關(guān)個(gè)體的標(biāo)準(zhǔn)。均以FSI:HSI≧1作為判定全同胞與半同胞關(guān)系的標(biāo)準(zhǔn)。
從等位基因匹配情況的結(jié)果得出,全相同、全不同的差異遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于半相同的差異;從共有基因數(shù)的結(jié)果得出,全同胞組、半同胞組及無(wú)關(guān)個(gè)體組的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。根據(jù)判定關(guān)系的實(shí)際情況,考慮分為3個(gè)組別:全同胞-半同胞組、全同胞-無(wú)關(guān)個(gè)體組及半同胞-無(wú)關(guān)個(gè)體組,分別得出檢測(cè)15個(gè)和24個(gè)基因
8、座初步判定標(biāo)準(zhǔn)。
按等位基因匹配情況和共有基因數(shù)分別建立檢測(cè)15個(gè)和24個(gè)基因座的判別函數(shù):全同胞-半同胞、全同胞-無(wú)關(guān)個(gè)體、半同胞-無(wú)關(guān)個(gè)體及全同胞-半同胞-無(wú)關(guān)個(gè)體,并得出判別函數(shù)準(zhǔn)確率或平均錯(cuò)判率。
3.親子親緣關(guān)系鑒定分析系統(tǒng)的設(shè)計(jì)
本課題針對(duì)常染色體STR分型結(jié)果,研究和開(kāi)發(fā)了一套全面適合于親子親緣鑒定的數(shù)據(jù)分析管理系統(tǒng),用以分析、計(jì)算、判定結(jié)果、管理檔案。軟件包括文件管理模塊、計(jì)算模
9、塊、資料庫(kù)功能模塊、統(tǒng)計(jì)模塊、用戶管理模塊和其他設(shè)置模塊。以Brenner法及ITO法分析方法為基礎(chǔ),設(shè)計(jì)和編寫(xiě)計(jì)算程序,能對(duì)符合和不符合遺傳關(guān)系、包括12種直系親子鑒定和隔代旁系親緣關(guān)系鑒定類別進(jìn)行自動(dòng)進(jìn)行計(jì)算和分析。
結(jié)論:本研究通過(guò)大量家系分析調(diào)查,獲得廣東漢族人群24個(gè)基因座的突變率,首次對(duì)各種分析存在突變基因案例的方法進(jìn)行比較,得出Brenner法為適合分析的方法。通過(guò)對(duì)全同胞、半同胞及無(wú)關(guān)個(gè)體的分析,得出ITO
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