中國(guó)五個(gè)地區(qū)獻(xiàn)血人群HCV基因型-亞型分布及進(jìn)化分析.pdf

1、目的：研究國(guó)內(nèi)五個(gè)地區(qū)血液中心獻(xiàn)血人群中HCV基因型/亞型分布及不同基因型HCV的群體遺傳學(xué)特征。
　　方法：收集來(lái)自重慶、烏魯木齊、洛陽(yáng)、綿陽(yáng)和廣西無(wú)償獻(xiàn)血人群的抗-HCV確證實(shí)驗(yàn)陽(yáng)性的血漿標(biāo)本802（人）份，并統(tǒng)計(jì)出獻(xiàn)血人群的性別、年齡、民族和職業(yè)等人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息;采用逆轉(zhuǎn)錄巢式PCR對(duì)HCV core基因片段擴(kuò)增并測(cè)序;應(yīng)用MEGA6.0軟件構(gòu)建HCV分子進(jìn)化樹(shù)并對(duì)其做基因分型和系統(tǒng)發(fā)育分析，用Arlequin、DNAsp和

2、BEAST軟件進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析，探討該地區(qū)不同基因型HCV的擴(kuò)張情況。采用SPSS Statistics17.0軟件來(lái)分析HCV基因亞型的分布和人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征的相關(guān)性。
　　結(jié)果：重慶(116)、烏魯木齊(104)、綿陽(yáng)(74)、洛陽(yáng)(67)和廣西(58)五個(gè)地區(qū)血漿標(biāo)本中獲得陽(yáng)性擴(kuò)增的共為419例。共檢測(cè)出HCV-1a、1b、2a、3a、3b、6a、6e和6n等8個(gè)基因亞型，未發(fā)現(xiàn)4，5型的存在，且各亞型所占比例分別為0.72

3、％(3/419)、59.90％(251/419)、16.95％(71/419)、4.53％(19/419)、3.82％(16/419)、12.41％(52/419)、0.95％(4/419)和0.72％(3/419)。綿陽(yáng)、烏魯木齊和洛陽(yáng)地區(qū)獻(xiàn)血人群中比例較高的基因型為1b和2a，而重慶和廣西地區(qū)為1b和6a。HCV1b和6a的Tajima's D值和Fu's Fs值均為負(fù)且P值均小于0.05，提示相應(yīng)的HCV群體正在經(jīng)歷擴(kuò)張。HCV基

4、因亞型的分布和年齡、民族之間有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＜0.05)，而與性別、職業(yè)、教育水平、婚姻狀態(tài)無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
　　結(jié)論：我國(guó)獻(xiàn)血人群HCV基因亞型豐度較高，主要以1b為主，其次為2a，也有6a，3a，3b，6e，6n及1a的散在分布。綿陽(yáng)、烏魯木齊和洛陽(yáng)地區(qū)獻(xiàn)血人群的優(yōu)勢(shì)基因型為1b和2a，而重慶和廣西地區(qū)為1b和6a。HCV6a亞型有顯著擴(kuò)張的趨勢(shì)，1b、3a和3b都有不同程度擴(kuò)張。HCV基因亞型的分布和年齡、民族存在統(tǒng)計(jì)學(xué)