利用微衛(wèi)星DNA技術(shù)對(duì)SPF種禽的分子遺傳學(xué)的研究.pdf

1、國(guó)家實(shí)驗(yàn)禽類種子中心依托于中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所，保存有BWEL-SPF雞種群和HBK-SPF鴨種群。其中BWEL-SPF種雞采循環(huán)雜交法封閉飼養(yǎng)14世代，在第15代改為最佳避免近交法交配方式，現(xiàn)保存有8個(gè)家系；HBK-SPF鴨根據(jù)蛋殼顏色分為HBK-B和HBK-Q2個(gè)家系，已繁育至第3代。本研究分別利用微衛(wèi)星DNA標(biāo)記，對(duì)第16代8個(gè)家系的BWEL-SPF種雞全群和第2、3代HBK-B-SPF鴨和HBK-Q-SPF種鴨全群進(jìn)行

2、了遺傳學(xué)分析，并對(duì)BWEL-SPF雞在主要組織相容性復(fù)合物(MHC)的遺傳背景進(jìn)行了初步探索。通過(guò)對(duì)SPF禽種群的雜合度、群體內(nèi)的近交水平以及群體間遺傳距離等的測(cè)定，為SPF種禽的品系選育、交配方式和特定疫病敏感性品系的建立等研究提供參考依據(jù)。結(jié)果表明： HBK-B和HBK-QSPF鴨在18個(gè)微衛(wèi)星DNA標(biāo)記位點(diǎn)共檢測(cè)到80個(gè)等位基因，各位點(diǎn)平均多態(tài)信息含量在0.49以上，期望雜合度分別介于0.560～0.618和0.570～0

3、.591之間，各位點(diǎn)的總?cè)后w遺傳雜合度在0.321～0.760之間，平均為0.571，亞群體遺傳雜合度在0.31～0.752之間，平均為0.565。這均表明HBK-SPF鴨群體內(nèi)的遺傳多樣性較高。對(duì)HBK-B鴨和HBK-Q鴨群體內(nèi)近交水平的顯著性檢驗(yàn)表明，群體內(nèi)部分位點(diǎn)的近交達(dá)到了顯著水平(P＜0.05)。表明群體內(nèi)已經(jīng)存在一定程度的近交。F統(tǒng)計(jì)量檢驗(yàn)表明，兩個(gè)世代的HBK-B和HBK-Q鴨群體間的遺傳分化均達(dá)到了極顯著水平(P＜0.0

4、01)；通過(guò)對(duì)HBK-B和HBK-Q鴨群體兩個(gè)世代間的等位基因頻率卡方檢驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)F2與F3世代間的HBK-B和HBK-Q鴨群體的等位基因頻率分別在6個(gè)和11個(gè)位點(diǎn)上存在顯著著異(P＜0.05)。這表明利用卵殼顏色來(lái)分別建群已經(jīng)達(dá)到了一定的效果，但需要通過(guò)擴(kuò)大有效群體含量等手段來(lái)提高這兩個(gè)群體的遺傳穩(wěn)定性。 應(yīng)用14個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記分析了SPF雞在F16世代群體內(nèi)的遺傳變異，結(jié)果表明長(zhǎng)期的近交已經(jīng)使相當(dāng)一部分位點(diǎn)(35.7％；5/14

5、)的基因型趨于純合(＞0.90)而被固定下來(lái)，群體內(nèi)等位基因的變異程度顯著降低。但在F16代改變傳代方式后，多數(shù)家系(7/8)的FIS估計(jì)值為負(fù)值，其中有4個(gè)達(dá)到了顯著水平(P＜0.05)，這表明經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期垂直傳代的家系內(nèi)的近交在一定程度上得到了緩解。F統(tǒng)計(jì)量檢驗(yàn)表明，各家系間的遺傳分化達(dá)到了極顯著水平(P＜0.001)，來(lái)自群體間的變異為12.9％，表明群體內(nèi)家系之間的遺傳分化曾經(jīng)達(dá)到過(guò)較高的水平。通過(guò)比較SPF雞與不同品種雞在等位基因