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文檔簡介
1、本文首先介紹無序列比對親緣分析方法中常用的距離和非相似度,并討論了它們是否是嚴(yán)格數(shù)學(xué)意義下的距離。本文發(fā)現(xiàn)有很多雖然被稱之為距離,但是實(shí)際上并不是數(shù)學(xué)意義下的距離。接著對隨機(jī)背景下的無序列比對親緣分析方法中提出使用三種新的非相似度。在動力學(xué)語言親緣分析方法中,提出用新的相似系數(shù)替代原來的夾角余弦系數(shù)。
文章用三組基因組數(shù)據(jù)對以上的方法從生物學(xué)角度進(jìn)行評價。
從生物學(xué)角度評價,基于隨機(jī)背景下的非相似度或者距離用于親緣分
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