DNA解旋酶動(dòng)力學(xué)研究.pdf

1、分子馬達(dá)是一類將ATP分子中的化學(xué)能或離子化學(xué)勢(shì)直接、高效的轉(zhuǎn)換為機(jī)械能，并產(chǎn)生協(xié)調(diào)的定向運(yùn)動(dòng)而做功的蛋白。作為分子馬達(dá)中的一員，DNA 解旋酶參與了包括DNA復(fù)制、修復(fù)、重組、轉(zhuǎn)錄及翻譯在內(nèi)的重要生命活動(dòng)，因此對(duì)解旋酶的研究具有重要現(xiàn)實(shí)意義。此外，多個(gè)分子馬達(dá)共同運(yùn)輸貨物在細(xì)胞生命活動(dòng)中扮演重要的角色，可使貨物的速度和運(yùn)輸距離增加，因此對(duì)多馬達(dá)協(xié)作運(yùn)輸?shù)难芯坑兄匾囊饬x。 本文主要研究?jī)?nèi)容如下： 1. DNA 自由能對(duì)

2、解旋速度的影響：（1）在DNA 一端加外力，DNA 自由能的減少等于外力與DNA 單鏈位移的乘積。隨外力增加，解旋酶的解旋速度明顯增加。（2）陽(yáng)離子濃度增加使DNA 分子磷酸集團(tuán)的靜電作用減弱，使解旋速度降低。鈉離子濃度的增加使解旋酶的解旋速度下降，鎂離子在較高和較低濃度時(shí)都抑制解旋酶的解旋速度。 2.依據(jù)解旋酶的解旋過(guò)程，將其相互作用由非對(duì)稱勢(shì)來(lái)描述。ATP水解提供能量和外界漲落的影響視為噪聲，以朗之萬(wàn)方程為基礎(chǔ)進(jìn)行模擬。結(jié)果