核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)受體家族系統(tǒng)進(jìn)化與表達(dá)調(diào)控的生物信息學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)受體家族成員(karyopherin B．superfamily)介導(dǎo)了真核生物中大多數(shù)生物大分子的跨核膜運(yùn)輸。目前人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了不同生理發(fā)育條件下細(xì)胞對底物核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)的多種調(diào)控機(jī)制，但對于該家族成員的系統(tǒng)進(jìn)化與基因表達(dá)調(diào)控尚知之甚少，因此我們采用生物信息學(xué)方法對這些未知的領(lǐng)域進(jìn)行了初步的探索。通過對8個物種(酵母、線蟲、果蠅、斑馬魚、爪蟾、原雞、小鼠和人類)中的核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)受體家族成員構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹，我們發(fā)現(xiàn)酵母中的10個核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)受

2、體祖先(KAP95、KAP123、KAP114、KAP120、KAP122、CRM1、MSN5、LOS1、MTR10和CSE1)與果蠅的XP06祖先，這11個祖先直接進(jìn)化為高等真核生物體內(nèi)相應(yīng)的直系同源物；而酵母中的另外4個祖先(KAP104、NMD5/SXM1和PSE1)和線蟲的XP07祖先則在進(jìn)化的過程中發(fā)生了基因倍增或內(nèi)含子缺失事件，最終進(jìn)化為相應(yīng)的旁系同源物。同時(shí)，我們研究了核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)受體成員的表達(dá)分布，發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)家族成員在人體

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