蘋果MdGLRs家族基因的生物信息學(xué)鑒定及表達(dá)分析.pdf

1、本文運(yùn)用生物信息學(xué)分析技術(shù)對(duì)蘋果中的MdGLRs基因及編碼蛋白進(jìn)行了初步研究，并簡(jiǎn)要分析了基因在冷害逆境下的表達(dá)情況。這些MdGLRs基因是根據(jù)蘋果基因組數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)的獲得，對(duì)于這些基因的具體的生理作用及如何參與體內(nèi)代謝是需要研究的內(nèi)容。本文的初步研究為克隆蘋果MdGLRs及鑒定其生物學(xué)功能奠定了重要基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下：
　　 1.從蘋果基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索出32個(gè)與AtGLRs對(duì)應(yīng)的、具有一定序列同源性的蘋果核酸和蛋白序列組成

2、蘋果MdGLRs家族。將所有MdGLRs分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三個(gè)亞家族，并進(jìn)行了編號(hào)。
　　 2.22個(gè)MdGLRs包含有全部與擬南芥同源的6個(gè)保守結(jié)構(gòu)域(S1-M1-M2-M3-S2-M4)；MdGLR3.9、MdGLR3.11、MdGLR3.13和AtGLR2.6缺失M2保守域，MdGLR2.2、MdGLR3.5、MdGLR3.13與AtGLR2.4、AtGLR2.6相似，含有結(jié)構(gòu)不完整的M3保守域，MdGLR3.14則沒(méi)有M4結(jié)

3、構(gòu)域。
　　 3.用SMART預(yù)測(cè)得出MdGLRs均為膜蛋白，內(nèi)部含有一個(gè)PBPs結(jié)構(gòu)域，PBPs具有外源谷氨酸門控離子通道活性，能綁定外源谷氨酸到離子通道復(fù)合體，使通道開放，催化離子的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)。TMHMM Serverv.2.0分析MdGLRs的跨膜結(jié)構(gòu)位置多位于500到800個(gè)氨基酸之間，該區(qū)域也是保守結(jié)構(gòu)域比較集中的區(qū)域。SOPMA程序預(yù)測(cè)MdGLRs蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)主要以由α-螺旋、無(wú)規(guī)則卷曲和折疊延伸鏈為主。PSORT預(yù)測(cè)

4、多數(shù)MdGLRs蛋白成員均主要在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和質(zhì)膜上定位。
　　 4.同一亞家族的基因中，各個(gè)成員基因在根、莖、葉中的表達(dá)情況有差異。
　　 5.MdGLR1.4在根、莖、葉、果皮、果肉中均有表達(dá)，在葉中表達(dá)量最高。在幼葉、成熟葉、老葉中的表達(dá)量為成熟葉>幼葉>老葉。
　　 6.低溫誘導(dǎo)MdGLR1.4在根、莖、葉中的表達(dá)，低溫+LaCl3處理使莖和葉中MdGLR1.4的表達(dá)量降低，同時(shí)ABA處理后的MdGLR1.4的