關(guān)于RNA分子自我復(fù)制過(guò)程中相變現(xiàn)象的研究.pdf

1、為了研究生物進(jìn)化,Eigen (1971)引入了一個(gè)關(guān)于分子進(jìn)化的動(dòng)態(tài)理論-準(zhǔn)生物種群模型。在這一模型中,有兩個(gè)概念非常重要。一個(gè)是適應(yīng)值結(jié)構(gòu),另一個(gè)是錯(cuò)誤閾?？偟膩?lái)說(shuō),適應(yīng)值結(jié)構(gòu)是指一個(gè)映射f:C→R,它給每-個(gè)C中的構(gòu)型賦一個(gè)實(shí)數(shù)值。這個(gè)實(shí)數(shù)值可以被看作是這一構(gòu)型適應(yīng)能力的度量。所謂錯(cuò)誤閾是指人群中能夠保持遺傳信息的最小的復(fù)制準(zhǔn)確度。如果復(fù)制過(guò)程中的保真度高于這一錯(cuò)誤閾,那么經(jīng)過(guò)若干代的進(jìn)化后,個(gè)體就會(huì)分布在主序列的周圍(每一個(gè)個(gè)體

2、都是一個(gè)0-1序列);否則,個(gè)體就可能分散在序列空間中。為了說(shuō)明準(zhǔn)生物種群模型,本文將引入復(fù)制刪除過(guò)程。這一過(guò)程可以描述如下：首先我們假定一個(gè)人群。在進(jìn)化的每一步,先從人群中選擇-個(gè)個(gè)體,選擇每個(gè)個(gè)體的概率與個(gè)體的適應(yīng)值成比例。然后這一個(gè)體自我復(fù)制,并允許其在每個(gè)位置依概率p發(fā)生變異。將最終得到的序列替換在剩下的人群中隨機(jī)選擇的個(gè)體。這樣,人群的個(gè)數(shù)保持不變。然后我們編程模擬這一過(guò)程,用所得數(shù)據(jù)畫(huà)圖,從而我們就可以看出最終個(gè)體的分布情況