蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)中的簡化編碼技術(shù).pdf

1、生物信息學(xué)是用計(jì)算機(jī)來處理和研究生物信息的一門新興學(xué)科.其中,蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)一直是生物信息學(xué)中的一個(gè)基本問題.如何獲得結(jié)果更準(zhǔn)確,時(shí)間空間效率最高的預(yù)測(cè)方法是生物信息學(xué)研究工作者的一個(gè)重要課題.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)一直在生物信息學(xué)中占有重要的地位.論文首先用一些篇幅簡要介紹了一下生物信息學(xué)的基本內(nèi)容和一些問題,接著用概要的語言闡述了生物信息學(xué)和生物實(shí)驗(yàn)的研究方法和重大意義;最后介紹了蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)和空間結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)的主要進(jìn)展和方法,

2、以及一些最新的研究成果.接著文章轉(zhuǎn)入理論內(nèi)容,主要介紹了神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建模預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的理論.更重要的是介紹了如何從一般概率體系出發(fā),更好的理解神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)這個(gè)經(jīng)常被視為與概率理論不相關(guān)的方法,這種思想將用來指導(dǎo)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)以及機(jī)器學(xué)習(xí)中代價(jià)函數(shù)的選擇.在最后,考慮神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)用于蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)時(shí),通常采用正交編碼.考慮到不同蛋白質(zhì)間的物理化學(xué)性質(zhì),由此提出了一種新的簡化的編碼技術(shù),并與其它蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的方法進(jìn)行了比較,通過數(shù)值計(jì)