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文檔簡介
1、核糖核苷酸還原酶(RR)是人類體內唯一的催化4種核糖核苷酸還原、生成相應的脫氧核糖核苷酸的酶。研究表明，人體小亞基R2能促進各種致癌基因的轉變，提高癌細胞的入侵能力。因此通過研究R2抑制劑，抑制腫瘤細胞的生成和轉移，已成為治愈人類癌腫的靶點研究之一，越來越受到關注。本文從結構生物信息學的角度研究人體中RR的小亞基R2蛋白質。首先，我們應用metaPocket2.0找出R2表面上可能的小分子作用位點，應用AutoDock Vina蛋白質與
2、小分子對接軟件對ZINC、DrugBank和PDB數(shù)據(jù)庫中大規(guī)模的小分子進行了虛擬篩選，篩選出9個可用于實驗驗證的小分子化合物。我們篩選出一個新的R2抑制劑，格列喹酮，它與2個活性位點的結合親和力值最好，為下一步實驗驗證提供依據(jù)。接著，我們應用ZDOCK蛋白質-蛋白質對接軟件進行R1和R2模擬對接，并利用metaPPI預測出R1和R2上的蛋白質結合位點，構造出4種RR全酶模型。最后，通過從結構和序列上比較人類R2與大腸桿菌的R2，以及通
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