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文檔簡(jiǎn)介
1、一、甌江彩鯉酪氨酸酶基因的克隆與序列分析
甌江彩鯉(Cyprinuscarpiovar.color)是分布在我國(guó)甌江流域的一種鯉科魚(yú)類,因其色彩艷麗,體形優(yōu)美,深受人們喜愛(ài)。甌江彩鯉有五種基本體色:“全紅”、“大花”、“麻花”、“粉玉”和“粉花”,是研究魚(yú)類體色遺傳的良好材料和理想模型。研究甌江彩鯉體色遺傳的分子機(jī)制,不僅能為觀賞性能的選育提供理論依據(jù),而且能為其他魚(yú)類的體色研究提供參考。
酪氨酸酶(tyro
2、sinase)是影響黑色素合成的關(guān)鍵酶,其轉(zhuǎn)錄的提前終止會(huì)導(dǎo)致黑色素?zé)o法合成。本論文應(yīng)用cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(RapidAmplificationofcDNAEnds,RACE)從甌江彩鯉皮膚的轉(zhuǎn)錄本中克隆了五種體色酪氨酸酶基因全序列,并對(duì)序列進(jìn)行分析。
實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)在甌江彩鯉的五種體色中,酪氨酸酶基因序列長(zhǎng)度存在差異,如“全紅”為2100bp,“麻花”為2107bp,“大花”為2073bp,“粉玉”為1976bp,“粉花
3、”為2111bp;且每種體色都有兩種類型酪氨酸酶基因mRNA的轉(zhuǎn)錄。通過(guò)分析其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)這兩種酪氨酸酶基因mRNA所翻譯成的氨基酸序列僅在一二級(jí)結(jié)構(gòu)上有所差異,而在結(jié)構(gòu)域和三級(jí)結(jié)構(gòu)上不存在差異,推測(cè)翻譯成的蛋白質(zhì)序列其作用也是一致的。本論文結(jié)果表明:酪氨酸酶基因的序列差異不是造成彩鯉不同體色差異的原因,甌江彩鯉黑色斑點(diǎn)或斑塊出現(xiàn)不是由酪氨酸酶基因直接決定的。
二、河鱸的群體結(jié)構(gòu)研究
河鱸(Percafl
4、uviatilisL.)是分布在歐亞大陸的重要淡水魚(yú)類。河鱸在歐洲分布廣泛,但在我國(guó),河鱸僅分布于新疆額爾齊斯河流域。因此,中國(guó)處在河鱸自然分布的東亞邊緣地區(qū)。由于遺傳和環(huán)境等原因,分布在邊緣地區(qū)的群體與其他地區(qū)相比,具有更高的滅亡危險(xiǎn)性。近年來(lái),有關(guān)邊緣群體的遺傳結(jié)構(gòu)研究也越來(lái)越多。
本論文首先開(kāi)發(fā)了12個(gè)河鱸微衛(wèi)星標(biāo)記,并對(duì)這些標(biāo)記進(jìn)行檢測(cè)。我們發(fā)現(xiàn)所開(kāi)發(fā)的標(biāo)記能夠有效評(píng)估河鱸群體的遺傳變異。其次,我們選取了8對(duì)微衛(wèi)星
5、標(biāo)記分析我國(guó)新疆額爾齊斯河流域的8個(gè)自然群體和一個(gè)移植群體。結(jié)果表明,我國(guó)的河鱸群體有較高的等位基因豐富度(7.097-8.662)和雜合度(HO=0.734-0.856,HE=0.798-0.876)。但在九個(gè)群體中,有六個(gè)群體檢測(cè)到顯著的遺傳瓶頸效應(yīng)。通過(guò)成對(duì)FST值、分子方差分析、貝葉斯遺傳聚類分析、主成分分析,發(fā)現(xiàn)群體間有顯著的遺傳分化。分析各位點(diǎn)所受到的選擇壓力,發(fā)現(xiàn)群體間產(chǎn)生了由于選擇壓力造成的適應(yīng)性進(jìn)化。通過(guò)分析,我們認(rèn)為
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