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文檔簡介
1、炎癥性腸?。↖nflammatory Bowel Disease)包括潰瘍性結腸炎(Ulcerative Colitis,UC)與克羅恩病(Crohn’s Disease,CD)。其中,UC的發(fā)病率高于CD的發(fā)病率,占IBD的主要部分。在中國,UC的發(fā)病率正處在于上升階段,若不加以防治,UC可能會成為一種流行性疾病。
UC的發(fā)生與發(fā)展受到遺傳與環(huán)境等多方面的影響。多項研究表明UC患者的腸道菌群結構與健康人的菌群結構顯著不同,并
2、且發(fā)現(xiàn)多種與人體共生的微生物可能與UC的發(fā)病有關。
本研究重點解析UC患者治療前后腸道菌群的變化,以及UC患者腸道菌群與健康人腸道菌群的差異。我們與南京市中醫(yī)院合作,共招募46例UC患者作為研究的志愿者,采用中藥氣藥灌腸法進行為期2-4周治療,采集治療前和治療后(出院前)兩個時間點的糞便樣品以及血液樣品。通過臨床統(tǒng)計分析,患者經(jīng)過治療,其 C反應蛋白、血沉以及便次均由病態(tài)恢復到正常水平。采用國際上常用的評價UC疾病狀態(tài)的指數(shù)R
3、achmilewitz臨床指數(shù)與Seo Score,表明患者經(jīng)過治療后病情得到了顯著緩解。
我們采用16S rRNA基因V1-V3區(qū)454焦磷酸測序的方法,對UC患者的腸道菌群進行研究,利用QIIME等分析測序結果。我們從實驗室樣品庫中選取了52位與UC患者年齡和性別大致匹配的健康人糞便樣本,作為UC腸道菌群分析的對照。Alpha與Beta多樣性分析顯示,UC患者經(jīng)過2-4周的治療腸道菌群多樣性以及結構沒有發(fā)生顯著變化,但與健
4、康人存在顯著差異。通過LEfSe,RDA等方法分析發(fā)現(xiàn),健康人糞便中存在較多的短鏈脂肪酸產(chǎn)生菌(如 Alistipes,Bacteroides,Clostridium VIa等),而UC患者中則存在較多的機會性致病菌(如內毒素產(chǎn)生菌Escherichia/Shigella,Salmonella,Streptococcus等)。由于短鏈脂肪酸(以丁酸為主)是腸道上皮細胞的主要的營養(yǎng)物質,因此短鏈脂肪酸產(chǎn)生菌的減少可能與UC、大腸癌等的發(fā)生
5、發(fā)展有關。而條件致病菌的增多會引發(fā)腸道炎癥,導致腸粘膜損傷。
對挑選出的與UC和健康相關的OTUs進行Spearman相關分析,發(fā)現(xiàn)UC中豐度較高的Escherichia/Shigella和Clostridium XVIII與短鏈脂肪酸產(chǎn)生菌Alistipes,Bacteroides,Lachnospiraceae,Ruminococcaceae等存在負相關關系,說明Escherichia/Shigella增多的同時,上述短鏈
6、脂肪酸產(chǎn)生菌豐度降低。Alistipes,Bacteroides,Lachnospiraceae,Ruminococcaceae等短鏈脂肪酸產(chǎn)生菌的部分OTUs之間存在正相關關系。
檢測 UC患者糞便提取液(Fecal Water,F(xiàn)W)對腸上皮細胞的細胞毒性發(fā)現(xiàn),治療前后糞便提取液的細胞毒性沒有顯著變化,并且UC患者治療前后的細胞毒性低于健康人糞便提取液的細胞毒性。該結果可能與UC患者糞便中含水量較高,有毒物質被稀釋有關。研
7、究中我們發(fā)現(xiàn),糞便提取液的細胞毒性存在較大的個體間差異,基于此,我們招募了12位青年健康志愿者,對其一段時間內糞便提取液的生物活性進行檢測,以了解健康人糞便提取液的穩(wěn)定性。結果發(fā)現(xiàn),相對于腸道菌群,健康人糞便提取液的生物活性表現(xiàn)出較大的個體間及個體內差異,這種差異與糞便提取液的TOC(Total Organic Carbon,總有機碳)含量以及糞便中含水量有關,并且受食物中的能量以及碳水化合物、蛋白質等的影響。糞便提取液生物活性的研究為
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