人類(lèi)基因表達(dá)和調(diào)控模式發(fā)現(xiàn)與綜合知識(shí)庫(kù)構(gòu)建.pdf

1、測(cè)序和基因組學(xué)產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)促成了生物信息學(xué)這門(mén)交叉學(xué)科的誕生，它的最終目的就是利用這些數(shù)據(jù)分析和解釋各種生理活動(dòng)，而基因表達(dá)和調(diào)控的研究是這門(mén)學(xué)科的重要內(nèi)容。生物體中的新陳代謝和信號(hào)通路，疾病在基因?qū)哟蔚闹虏C(jī)理和對(duì)藥物治療的反饋等都和基因表達(dá)與調(diào)控密切相關(guān)。所以，對(duì)基因表達(dá)與調(diào)控的研究將會(huì)極大地幫助其他方面的研究。本文的主要內(nèi)容如下:
　　為了全面的評(píng)估人類(lèi)基因表達(dá)，我們搜集和篩選了600個(gè)人類(lèi)微陣列數(shù)據(jù)集，并從4個(gè)維度對(duì)數(shù)據(jù)

2、進(jìn)行提取和分類(lèi):1）在細(xì)胞、組織或者和器官層次的表達(dá)數(shù)據(jù);2）在胎兒、青年和老年生長(zhǎng)階段的表達(dá)數(shù)據(jù);3）在疾病和健康狀態(tài)下的表達(dá)數(shù)據(jù);4）在不同化學(xué)處理下的時(shí)間序列表達(dá)數(shù)據(jù)。對(duì)于提取的數(shù)據(jù)，我們應(yīng)用了2個(gè)統(tǒng)計(jì)方法來(lái)評(píng)估基因的表達(dá)，用戶(hù)可以在這兩個(gè)方法上設(shè)置不同的閾值，來(lái)得到特異性表達(dá)的基因和看家基因。
　　在生物體中，一般都是由一組基因來(lái)執(zhí)行某種功能。根據(jù)一組基因在不同條件下表達(dá)水平，可以發(fā)掘基因的表達(dá)模式或者所處條件的相似性。針