人類基因組結(jié)構(gòu)注釋數(shù)據(jù)庫構(gòu)建及數(shù)據(jù)可視化展示.pdf

1、國際人類基因組計劃首席科學家Collins明確指出基因組研究的下一個階段是注釋出基因組中的各功能元件。其中，了解基因DNA中的蛋白質(zhì)編碼基因及其內(nèi)部結(jié)構(gòu)，是了解基因組功能的首要核心問題。為此，對人類基因組蛋白質(zhì)編碼基因及其結(jié)構(gòu)進行收集、整合和預(yù)測，建立人類基因組數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，面向全世界公開發(fā)布注釋的人類基因組結(jié)構(gòu)注釋數(shù)據(jù)成為目前各大生物信息著名研究機構(gòu)的研制重點。
　　 對于人類基因組蛋白質(zhì)編碼基因及其結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的收集和獲取而言，構(gòu)

2、建可靠數(shù)據(jù)集和提供相應(yīng)的預(yù)測注釋數(shù)據(jù)是該工作不可或缺的兩部分。其中構(gòu)建來源于實驗方法的可靠數(shù)據(jù)集不僅可提供準確無誤并具有相應(yīng)支持證據(jù)的可靠數(shù)據(jù)，同時還可滿足基因結(jié)構(gòu)預(yù)測相關(guān)研究對數(shù)據(jù)集的需求；另一方面，基于生物信息學方面預(yù)測得到的基因組蛋白質(zhì)編碼基因及其結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)將成為可靠數(shù)據(jù)的有益補充，適應(yīng)基因組數(shù)據(jù)的迅速增長。
　　 建立了人類基因組結(jié)構(gòu)注釋數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，存儲和管理人類基因組蛋白質(zhì)編碼基因及其結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)。通過理解人類基因組結(jié)構(gòu)注釋

3、數(shù)據(jù)內(nèi)容以及數(shù)據(jù)關(guān)系，詳細的分析人類基因組注釋系統(tǒng)關(guān)鍵的事務(wù)處理流程，利用關(guān)系型數(shù)據(jù)庫設(shè)計方法設(shè)計了數(shù)據(jù)的存儲模型，并根據(jù)數(shù)據(jù)對象的特點與應(yīng)用的特殊性，采用了冗余備份的思想優(yōu)化數(shù)據(jù)庫的訪問效率，并根據(jù)不同的數(shù)據(jù)變化方式，提出了相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫擴展方法。
　　 對人類基因組蛋白質(zhì)編碼基因及其結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進行了web發(fā)布，實現(xiàn)了基因組結(jié)構(gòu)注釋數(shù)據(jù)的web瀏覽訪問。采用了分層策略與“軌道”的顯示方式可視化展示注釋數(shù)據(jù)，并采用了SVG圖形技術(shù)克