版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、對(duì)于基因組的排序問題在近幾年得到了廣泛的研究.新的斷點(diǎn)圖的方法被發(fā)現(xiàn)并對(duì)算法的設(shè)計(jì)起了重要的作用.在這篇論文中,主要研究了基因組排序問題中三種不同操作的排序問題的算法,這三個(gè)問題的難度有所不同.反轉(zhuǎn)操作是將一個(gè)基因序列的一個(gè)子序列的順序反轉(zhuǎn)過來.反轉(zhuǎn)排序有O(n2)的多項(xiàng)式時(shí)間算法.轉(zhuǎn)位操作是將一個(gè)基因序列中的兩段相鄰的子序列交換位置.轉(zhuǎn)位問題現(xiàn)在只有近似比為3/2的近似算法.移位操作是將兩個(gè)基因序列在中間斷開,在將分屬兩個(gè)基因序列的子
2、序列重新連接起來,形成兩個(gè)新的基因序列.移位排序也有多項(xiàng)式時(shí)間算法.本文主要對(duì)于有向基因組移位排序問題進(jìn)行了研究,對(duì)于有向染色體組移位排序問題,Kececioglu與Ravi首先給出近似性能比為2的多項(xiàng)式時(shí)間近似算法,Hannenhalli利用斷點(diǎn)圖的性質(zhì),證明了一個(gè)重要的二元定理,并由此證明了該問題有多項(xiàng)式時(shí)間算法.Hannenhalli于1996年給出的移位排序算法的時(shí)間復(fù)雜度為O(n<'3>),2001年朱大銘,馬紹漢將Hanne
3、nhalli算法的時(shí)間復(fù)雜度改進(jìn)為O(n<'2>logn).本文的主要成果和創(chuàng)新點(diǎn)如下:·給出了尋找斷點(diǎn)圖中所有最小子排列的O(n<'2>)算法.·發(fā)現(xiàn)了斷點(diǎn)圖中的最右灰邊并證明了其特殊性質(zhì).·給出了基于最右灰邊的線性的無用頂點(diǎn)刪除算法.·給出尋找有效合理移位的線性算法,并在此基礎(chǔ)上,最終給出了基因組移位排序問題的O(n<'2>)的快速算法,這也是目前為止,該問題的最好算法.本文本文的組織如下:第一章為背景介紹,第二章介紹有向染色體反轉(zhuǎn)
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 基因組重組排序問題的算法研究.pdf
- 關(guān)于部分排序的基因組重組問題的研究.pdf
- 無向基因組的移位排序算法.pdf
- 有向基因組翻轉(zhuǎn)排序問題快速算法的實(shí)現(xiàn).pdf
- 無向基因組翻轉(zhuǎn)排序問題的快速計(jì)算方法.pdf
- 基因組移位排序算法的改進(jìn)和評(píng)測(cè).pdf
- 計(jì)算生物學(xué)中基因組重組排序問題的算法研究.pdf
- 計(jì)算生物學(xué)中有關(guān)基因組移位刪除排序問題的研究
- 基因組Reversal-Transposition排序的快速計(jì)算研究.pdf
- 計(jì)算生物學(xué)中有關(guān)基因組移位-刪除排序問題的研究.pdf
- 有向基因組復(fù)合操作重組排序算法研究.pdf
- 有向基因組的反轉(zhuǎn)和轉(zhuǎn)位排序算法.pdf
- 基因、基因組和基因組學(xué)
- 基因組變異仿真與基因組模式鑒定.pdf
- 無參考基因組的比較基因組學(xué)研究.pdf
- 木瓜核基因組和線粒體基因組的拼接和初步分析.pdf
- 基因和基因組結(jié)構(gòu)分析.pdf
- 水稻線粒體基因組——序列多態(tài)性和基因組進(jìn)化,以及線粒體、葉綠體和細(xì)胞核基因組間的基因遷移.pdf
- 單子葉植物基因組結(jié)構(gòu)和功能的比較基因組研究.pdf
- 公共鄰接距離基因組片段填充問題研究.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論