基于復雜網絡和社區(qū)探測方法的熱區(qū)預測方法研究.pdf

1、已有的研究表明,熱點是分布在蛋白質界面上,但分布并不是均勻的,而是聚集在局部的緊密填充的區(qū)域,稱為熱區(qū)。熱區(qū)才是穩(wěn)定并協(xié)調蛋白質-蛋白質相互作用的關鍵因素,熱區(qū)的發(fā)現與界定對于揭示諸如細胞的代謝和信號傳導途徑、免疫確認、DNA復制、基因翻譯和蛋白質合成等蛋白質功能活動具有重要意義,因而如何有效地發(fā)現和預測熱區(qū)是一個值得研究的課題。
　　本文的研究重點是基于蛋白質-蛋白質相互作用(PPIs)的復雜網絡特性和社區(qū)結構,結合社區(qū)探測方法

2、和熱點回收策略來預測PPIs的熱區(qū),提出了一種預測PPIs的熱區(qū)方法:HRPH(基于熱點的熱區(qū)預測,Hot Region Prediction Based on Hotspots)是基于熱點預測的結果集,根據熱區(qū)形成規(guī)則構成初步的熱區(qū)預測集;在形成初步的熱區(qū)預測集后,利用社區(qū)探測方法探測熱區(qū)所在的社區(qū),然后通過熱點回收策略對初步結果集中的假陽性和假陰性殘基進行更正和回收,通過對初步得到的熱區(qū)結果集進行優(yōu)化獲得最終的熱區(qū)預測集。