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1、復(fù)旦大學(xué)碩士學(xué)位論文MHC與多肽綁定研究姓名：陳益青申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：計(jì)算機(jī)軟件與理論指導(dǎo)教師：周水庚20110512AbstractAbstractMHCmolecularplaysasignificantroleinimmunologybecausethebindingofMHCtopeptideistheprerequisiteforTcellimmunityInthefiledofbioin—formatics，manyr
2、esearchesfocusonthepredictionofpeptidebindingtoMHCTheresearchofpredictionofMHCbindingisnotonlyusefulinunderstandingtheprocessofimmunologybutalsoishelpfulforcomputer—aidedvaccinedesignMyresearchhasthreepurposeFirstly，deve
3、lopeanovelclassifierbasedonensemblelearningwhichhasbetterperformanceinpredictionSecondlymostmethodsofMHCbindingpredictionisonlyfromthepeptidesequenceinformationButinthenewmethodweshouldcombinepeptidesequenceandMHCstructu
4、reinformationsLastlydiversityofMHCmakesthewidelypredictionofMHCbindingverydifficult，especiallyMHCmolecularwhichhasfewpeptidebindinginformation；inthisresearchwetrytosolvethisproblemInresponsetothesethreepurpose，wedevelope
5、damethodcalledTEPI—TOPEpanandmanufactureaintegratedclassifierTEPITOPEpanwhichcombinessequenceandstructureinformationisamethodthatcouldbeusedindifferenceallelesAllMHCmoleculesthathavesequenceinformationcouldbecal—culateda
6、Positionspecificscoringmatrix(PSSM)forpredictionofbindingusingTEPITOPEpanIntegratedclassifierbasedonthethreemethodsthathavegoodperformanceisveryexcellentinpredictionofMHCbindingKeywords：MHCmolecular，Positionspecificscori
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