AUV多源觀測數(shù)據(jù)融合方法及應(yīng)用技術(shù)研究.pdf

1、隨著人類基因組計(jì)劃的順利進(jìn)展,越來越多的蛋白質(zhì)序列被測定出來,而利用實(shí)驗(yàn)方法測量蛋白質(zhì)及生物大分子的結(jié)構(gòu)相當(dāng)繁瑣,既耗時(shí)又費(fèi)力,因此利用理論計(jì)算方法來研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能從而指導(dǎo)實(shí)驗(yàn)是一項(xiàng)非常有意義的工作。本文從蛋白質(zhì)的一級序列出發(fā)使用多分類器組合算法對固有不規(guī)則蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行分類研究,論文主要工作如下:
　　 1、構(gòu)建規(guī)則和不規(guī)則蛋白質(zhì)序列這兩類序列集,依據(jù)長度不同的不規(guī)則蛋白質(zhì)序列中氨基酸殘基含量的不同,將不規(guī)則數(shù)據(jù)集分為

2、長(＞30個(gè)氨基酸殘基)和短(≤30個(gè)氨基酸殘基)兩個(gè)序列集。
　　 2、基于氨基酸序列的單肽、雙肽結(jié)構(gòu)屬性和疏水性物理屬性出發(fā),利用滑動(dòng)窗口法將氨基酸序列量化,利用徑向基核函數(shù)的支持向量機(jī)方法構(gòu)建成員預(yù)測器模型。利用5倍交叉驗(yàn)證法確定長、短序列的窗口長度以及由此確定支持向量機(jī)核函數(shù)的參數(shù)值gamma值和懲罰系數(shù)coat值。
　　 3、在特征提取方面,由于滑動(dòng)窗口法得到的數(shù)據(jù)矩陣容易形成維災(zāi)難,需要對矩陣進(jìn)行維數(shù)規(guī)約,即

3、將數(shù)據(jù)由高維空間投影到低維空間。主要分析了現(xiàn)在常用的降維方法包括線性降維方法中主成分分析法(PCA)以及一種基于PCA方法發(fā)展起來的一種非線性降維方法一核主成分分析法(KPCA)。在此基礎(chǔ)上本文將流形學(xué)習(xí)算法中局部線性嵌入法(LLE)引入了固有不規(guī)則蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測中,并利用實(shí)驗(yàn)方法對PCA、KPCA以及LLE算法進(jìn)行了驗(yàn)證,得出基于LLE方法的降維效果最好,從而得出蛋白質(zhì)序列中氨基酸殘基之間存在局部線性關(guān)系。
　　 4、為了提高