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1、目的:通過(guò)全基因組寡核苷酸芯片篩查鼻咽癌紫杉醇耐藥細(xì)胞株中的耐藥相關(guān)基因,重點(diǎn)分析ATP-結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體基因在鼻咽癌細(xì)胞對(duì)紫杉醇產(chǎn)生耐藥過(guò)程中的作用。 方法: 1.集落形成實(shí)驗(yàn)檢測(cè)已建立的人鼻咽癌耐藥細(xì)胞株CNE-1/Taxol的耐藥指數(shù)。 2.將處理前后的鼻咽癌的CNE-1細(xì)胞株及其耐藥細(xì)胞株CNE-1/Taxol實(shí)施RNA抽提,并按程序進(jìn)行基因芯片實(shí)驗(yàn)操作。3.運(yùn)用GCOS和dChip軟件對(duì)鼻咽癌紫杉醇耐藥細(xì)胞系CNE-1/T
2、axol及其親本細(xì)胞系CNE-1之間的基因表達(dá)差異進(jìn)行大規(guī)模的分析。 結(jié)果: 1.將己建立的鼻咽癌耐藥細(xì)胞株進(jìn)行集落形成實(shí)驗(yàn)3次,確定其ICso值為7.98ng/ml,耐藥指數(shù)為7.00±0.62。 2.利用dChip軟件,經(jīng)過(guò)兩次篩選,找出了不僅在耐藥細(xì)胞株中高表達(dá),并且經(jīng)IC<,50>紫杉醇藥物處理后繼續(xù)上調(diào)的8個(gè)基因。這些基因是MB(肌紅蛋白)、MAOA(單胺氧化酶A)、FOLR1 (葉酸鹽受體)、DNER(δ表皮生長(zhǎng)因子
3、相關(guān)受體)、OR2A7(氣味分子受體)、CFH(補(bǔ)體H因子)、DERP12(真皮乳頭衍生蛋白12)、KIAA0500(KIAA0500蛋白)。 3.發(fā)現(xiàn)了8個(gè)在耐藥細(xì)胞中表達(dá)上調(diào)2倍以上的ATP-結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體基因:ABCA7(ATP-結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體A7)、ABCB10(ATP-結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體B10)、ABCC1(多藥耐藥相關(guān)蛋白1,MRP1)、ABCC4(多藥耐藥相關(guān)蛋白4,MRP4)、ABCC5(多藥耐藥相關(guān)蛋白5,MRP5)、ABCC6
4、(多藥耐藥相關(guān)蛋白6,MRP6)、ABCD3(ATP-結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體D3)和ABCG2(乳腺癌耐藥蛋白,BCRP),這些基因在CNE-1/Taxol的表達(dá)隨半數(shù)抑制劑量的紫杉醇處理后均未出現(xiàn)繼續(xù)上調(diào)。 結(jié)論: 1.經(jīng)cDNA Microarray實(shí)驗(yàn),并利用dChip軟件,經(jīng)過(guò)兩次篩選,發(fā)現(xiàn)了MB、MAOA、FOLR1、CFH、KIAA0500、DNER、OR2A7和DERP12在紫杉醇耐藥細(xì)胞系中高表達(dá),而且隨IC<,50>紫杉
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