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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分轉(zhuǎn)運(yùn)體基因3’-UTR上的SNP與人結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展及化療反應(yīng)相關(guān)性研究
【目的】探討轉(zhuǎn)運(yùn)體基因3’-UTR上的SNP與人結(jié)直腸癌發(fā)生、臨床病理參數(shù)、化療副反應(yīng)及化療療效的相關(guān)性。
【方法】首先,篩選轉(zhuǎn)運(yùn)體基因上的 SNP位點(diǎn),并設(shè)計(jì)等位基因特異性引物;其次,收集175例結(jié)直腸癌患者和300例健康人的外周血,從中提取DNA;然后,采用等位基因特異性擴(kuò)增法測(cè)定轉(zhuǎn)運(yùn)體基因上的 SNP基因型;最后,用統(tǒng)計(jì)軟件分析S
2、NP基因型與人結(jié)直腸發(fā)生、臨床病理參數(shù)及化療反應(yīng)的相關(guān)性。
【結(jié)果】(1)研究了6個(gè)位于轉(zhuǎn)運(yùn)體基因3’-UTR上的SNP位點(diǎn)基因型與結(jié)直腸癌發(fā)生的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn),rs3742106、rs63282661和rs1059751的等位基因及基因型分布頻率在結(jié)直腸癌患者和健康人群中存在顯著差異(P<0.05)。其中,rs3742106與結(jié)直腸癌的相關(guān)性最為顯著;與 GG基因型相比,TT基因型(OR=0.434,95%CI=0.215
3、-0.875)、TG基因型(OR=0.589,95% CI=0.387-0.895)和T等位基因攜帶者(OR=0.614,95% CI=0.451-0.836)患結(jié)直腸癌的風(fēng)險(xiǎn)均更低。此外,病例組中T等位基因頻率也顯著低于對(duì)照組中T等位基因頻率(24.84%vs34.98%;P=0.002),提示T等位基因可能對(duì)結(jié)直腸癌的發(fā)生起到保護(hù)作用。rs562、rs3177514和rs2458225的等位基因及基因型分布頻率在結(jié)直腸癌和正常人群中
4、的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(2)臨床病理參數(shù)相關(guān)性分析結(jié)果表明,rs1059751位點(diǎn)基因型與患者腫瘤浸潤(rùn)深度相關(guān),其CT基因型在T3+T4患者中的頻率顯著低于TT型,提示CT基因型可能不利于腫瘤浸潤(rùn),起到保護(hù)機(jī)體的作用。rs2458225的基因型與腫瘤大小相關(guān),其 CT基因型患者的腫瘤似乎比TT型患者的小,也可能起到保護(hù)作用。(3)與5-FU化療反應(yīng)相關(guān)性分析結(jié)果表明,除了rs3742106的基因型與化療副反應(yīng)的發(fā)生幾近相關(guān)(P=0.069
5、)之外,其余SNP位點(diǎn)的基因型與結(jié)直腸癌化療副反應(yīng)及療效之間均無(wú)明顯相關(guān)性。
【結(jié)論】ABCC4基因3’-UTR上的SNP位點(diǎn)rs3742106與人結(jié)直腸癌的發(fā)生顯著相關(guān),其T等位基因可能對(duì)結(jié)直腸癌發(fā)生起到保護(hù)作用。
第二部分 ABCC4基因3’-UTR上的SNP rs3742106對(duì)miRNA調(diào)控作用的影響
【目的】研究ABCC4基因3’-UTR上的SNP位點(diǎn) rs3742106對(duì)miRNA調(diào)控作用的影響
6、。
【方法】首先,構(gòu)建ABCC4基因上miR-105、miR-3148和miR-3190-5p作用靶點(diǎn)序列的兩種基因型(GG和TT)熒光素酶表達(dá)載體;其次,將構(gòu)建好的載體和miRNA共同轉(zhuǎn)染CHO細(xì)胞,并用雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)測(cè)定基因活性;最后,運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件分析SNP位點(diǎn)rs3742106對(duì)miRNA調(diào)控作用的影響。
【結(jié)果】(1)與對(duì)照組熒光素酶活性相比,miR-105、miR-3148和miR-3190-5p分別
7、能顯著抑制TT、GG和GG型重組熒光素酶的活性(P<0.05)。(2)比較兩種不同基因型重組熒光素酶的活性發(fā)現(xiàn),miR-3148(P=0.022)和miR-3190-5p(P=0.024)組存在顯著差異,而miR-105的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.23),提示SNP位點(diǎn)rs3742106對(duì)miR-3148和miR-3190-5p抑制ABCC4基因表達(dá)的作用存在影響。
【結(jié)論】 SNP位點(diǎn)rs3742106通過(guò)影響miR-314
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