木霉菌進化選擇壓力的比較基因組分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、木霉菌(Trichoderma)種類較多、品類繁雜，由于它們具有顯著的生物防治功能，被廣泛應(yīng)用于生物防治真菌。由于木霉菌的經(jīng)濟價值，有關(guān)木霉菌的功能和生物防治機制的研究很活躍。本研究針對鉤狀木霉菌Trichoderma hamatum的兩個新菌株YYH13和YYH16。它們在生物防治和纖維素降解能力上都具有明顯的差異。與YYH16相比，YYH13具有更強的生物防治能力。為了尋找鉤狀木霉菌基因組中參與生物防治的基因，從而幫助理解鉤狀木霉的

2、生物防治機制，我們對YYH13和YYH16的基因組進行了測序、組裝、基因注釋、和功能注釋。利用這些信息，我們進一步尋找了鉤狀木霉基因組的基因組特異基因，展開了基因組的共線性，以及選擇壓力的分析。選擇壓力分析可以幫助尋找在進化中與木霉菌適應(yīng)相關(guān)的基因。在基因的選擇壓力分析中，我們主要針對GH家族，找到了36個正選擇位點，其中YYH13中受到影響的正選擇基因有三個，而YYH16受到影響的正選擇基因只有一個。其中一個與生物防治相關(guān)的基因枯草芽

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