玉米全基因組IQD基因的分析及進化研究.pdf

1、獨創(chuàng)性聲明本人聲明所呈的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)或其他教育機構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同二[作的同志對本研究所做的任何貢獻均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名：壘＆簽字日期：刀J≯年b月，日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用

2、學(xué)位論文的規(guī)定，有權(quán)保留并向國家有關(guān)部門或機構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子文件，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索，收錄到《中國學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫》，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文，向社會公眾提供信息服務(wù)。(保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書)。學(xué)位論文作者簽名：鎰簽字日期：偽7y年c|月9日學(xué)位論文作者畢業(yè)后去向：工作單位：通信地址：指導(dǎo)教師簽名：之絲簽字日期

3、：仍7b年b月了日電話：郵編：摘要鈣離子是植物細(xì)胞內(nèi)的第二信使參與了胞內(nèi)眾多的生理反應(yīng)。對于鈣離子受體蛋白的結(jié)合蛋白的研究，將有助與闡明CaM信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的特性及功能。近年來，對植物中的鈣調(diào)素結(jié)合蛋白類型基因的研究成為熱點問題。本研究通過使用生物信息學(xué)軟件對玉米全因組中的IQD類型基因進行結(jié)構(gòu)分析、系統(tǒng)進化和表達分析，對于IQD基因的分子克隆和分子進化的研究具有重要指導(dǎo)意義。獲得主要結(jié)果如下：1對玉米的全基因組進行搜索比對和篩選，一共獲得3

4、1個不同的IQD基因。分別命名為ZmlQDlZmlQD31。通過進化樹的分析，發(fā)現(xiàn)玉米與水稻，高粱的基因具有較高的同源性和共線性，表明玉米IQD類型基因與單子葉植物的親源性較近，而與雙子葉植物間的親源性相對較遠(yuǎn)，在進化關(guān)系上出現(xiàn)物種間的差異性。2對玉米IQD類型基因進行染色體物理位置的定位繪制，結(jié)果顯示31個IQD基因分散的分布在玉米的十條染色體上，8號染色體上最多，有7個基因；2、7號染色體最少，各有1個基因，沒有出現(xiàn)明顯的基因簇現(xiàn)象

5、，與其他物種的染色體定位具有相同特性。3對玉米IQD類型基因的結(jié)構(gòu)進行比對，在進化關(guān)系中同屬一個分類的IQD基因其基因結(jié)構(gòu)較為相似，所含內(nèi)含子與外顯子的個數(shù)也基本相同。在31個玉米IQD基因同源性比對分析表明組成IQD基因功能核心區(qū)域的氨基酸序列具有較高的相似性和重復(fù)性。4基序分析顯示玉米IQD類型基因包含有20種不同的基序。motif16這幾種基序出現(xiàn)在絕大多數(shù)玉米IQD基因中，而motif15，19，20這三種基序只在少數(shù)基因中出現(xiàn)