稻瘟病菌3端非翻譯區(qū)和水稻胚乳基因的生物信息學(xué)分析.pdf

1、本文對(duì)稻瘟病菌3端非翻譯區(qū)序列進(jìn)行了相關(guān)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)挖掘和分析，給出了稻瘟病菌mRNA poly(A+)位點(diǎn)周圍3'末端加工相關(guān)順式作用元件分布的總體結(jié)構(gòu)模型。其中上游遠(yuǎn)端調(diào)控元件有T-rich、TG-rich和GA-rich元件；上游近端調(diào)控元件主要包括T-rich和A-rich元件；下游近端調(diào)控元件主要包括T-rich、A-rich和TGAT元件；下游遠(yuǎn)端調(diào)控元件主要為T-rich元件，可能是一類輔助元件。本文還發(fā)現(xiàn)超過三分之一的

2、稻瘟病菌基因存在2個(gè)以上polyA位點(diǎn)。 水稻胚乳在稻谷發(fā)芽生長(zhǎng)過程起著重要作用，并且決定著稻米的品質(zhì)。目前對(duì)于胚乳全局基因表達(dá)譜知之甚少，為更好的了解水稻胚乳相關(guān)基因的表達(dá)情況，本文采用表達(dá)序列標(biāo)簽技術(shù)對(duì)胚乳cDNA文庫(kù)進(jìn)行了測(cè)序。同時(shí)基于EST結(jié)果構(gòu)建了cDNA陣列，與來自水稻不同組織或器官的cDNA進(jìn)行雜交，用以檢測(cè)胚乳特異高表達(dá)基因。EST結(jié)果表明醇溶谷蛋白、谷蛋白、過敏蛋白以及淀粉合成酶編碼基因在胚乳中高度冗余，約占胚