金不換原小檗堿型生物堿有效成分的活性構(gòu)象研究.pdf

1、金不換(Stephania delavayi Diels)是一類具有相似塊根的防己科千金藤屬植物。其塊根是一味中草藥,味苦,性寒,有小毒,具有鎮(zhèn)痛、截虐、清熱解毒、散瘀消腫等功效,是我國(guó)華南和西南地區(qū)的民間常用藥。根據(jù)《中國(guó)植物志》記載,我國(guó)千金藤屬植物有39種和1個(gè)變種,具有產(chǎn)量大,價(jià)格低廉的特點(diǎn)。金不換富含大量生物堿,且其中多種生物堿都有鎮(zhèn)痛、鎮(zhèn)靜、消炎等作用,同時(shí)具有抗藥物依賴作用,具有較強(qiáng)的生物活性,引起國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)其進(jìn)行了廣泛

2、的研究。
　　 本論文研究的目的和意義是:在前人研究的基礎(chǔ)上,采用量子化學(xué)計(jì)算和分子模擬等方法探究金不換中原小檗堿型生物堿有效成分的活性構(gòu)象,為進(jìn)一步研究其鎮(zhèn)靜鎮(zhèn)痛作用的藥理機(jī)制和抗藥物依賴的作用機(jī)制提供理論依據(jù)。
　　 本論文的主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:
　　 1.分析金不換中原小檗堿型生物堿的化學(xué)結(jié)構(gòu)特點(diǎn),整理出其中具有較強(qiáng)抗成癮性藥物依賴作用的有效成分,確定各成分的低能構(gòu)象。具體方法為:首先應(yīng)用GaussVi

3、ew4.1軟件搭建出金不換中原小檗堿型生物堿有效成分的三維立體結(jié)構(gòu)圖。其次,應(yīng)用Conflex6.0程序搜索各生物堿有效成分的所有可能存在的穩(wěn)定構(gòu)象。最后,采用Gaussian03程序,用密度泛函理論中的B3LYP方法,基組設(shè)為6-31G**,對(duì)Conflex的搜索結(jié)果進(jìn)行幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化和諧振頻率分析,確認(rèn)其是否為能量極小點(diǎn),并用零點(diǎn)能校正總能量。結(jié)果表明,經(jīng)優(yōu)化后得到的各生物堿有效成分的低能構(gòu)象中,所有頻率分析計(jì)算的結(jié)果中皆無虛頻,表明

4、計(jì)算的各構(gòu)象均為其勢(shì)能面上的穩(wěn)定駐點(diǎn),各項(xiàng)結(jié)構(gòu)參數(shù)是合理的,可以推測(cè)出這些構(gòu)象能夠穩(wěn)定存在。
　　 2.采用同源模建的方法構(gòu)建多巴胺D2受體的三維結(jié)構(gòu)。具體操作過程為:選擇人的β2-腎上腺素受體(p2AR)為模板,應(yīng)用SYBYL8.1中的APM(Advanced Protein Modeling)蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模塊進(jìn)行同源模建。模建完成后,設(shè)定周期性邊界參數(shù),將圖形置于水環(huán)境中,選擇AMBER7 FF99力場(chǎng),依次采用最速下降法(

5、steepest descent)和共軛梯度法(conjugate gradient)進(jìn)行能量?jī)?yōu)化和模型修正,最后應(yīng)用PROCHECK程序中的Ramachandran Plot,氨基酸與側(cè)鏈、主鏈的碰撞情況等來檢驗(yàn)?zāi)Ｐ偷馁|(zhì)量。結(jié)果表明模建的D2受體結(jié)構(gòu)氨基酸的二面角是比較合理的,且整個(gè)模建過程中模建蛋白質(zhì)的氨基酸序列未發(fā)生明顯碰撞。
　　 3.采用分子對(duì)接的方法研究多巴胺D2受體與原小檗堿型生物堿有效成分(配體)的相互作用,找出