湖南和廣西兩省區(qū)豬圓環(huán)病毒2型的PCR檢測(cè)和流行毒株全基因組的克隆測(cè)序及分析.pdf

1、豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2)是引起豬斷奶后多系統(tǒng)衰竭綜合征等相關(guān)疾病的重要病原。本文采用PCR技術(shù)，對(duì)2006-2007年我國(guó)廣西和湖南省區(qū)的PCV-2流行情況進(jìn)行了檢測(cè)和病毒全基因組克隆測(cè)序及分析。 本研究對(duì)采集于我國(guó)廣西和湖南等地的301份(廣西140份，湖南161份)豬高熱綜合征病料進(jìn)行了圓環(huán)病毒2型的PCR檢測(cè)，共檢出PCV-2陽(yáng)性121例，其中廣西54例PCV-2陽(yáng)性率為38.5％；湖南67例，陽(yáng)性率為41.6％，證明

2、我國(guó)廣西湖南兩地：PCV-2感染較嚴(yán)重，PCV-2是導(dǎo)致豬高熱綜合征的一個(gè)重要病原。 本研究采用PCR技術(shù)分段擴(kuò)增的方法，擴(kuò)增來(lái)自廣西和湖南的PCV-2病毒基因組核苷酸序列，進(jìn)行克隆測(cè)序；測(cè)序結(jié)果用DNASTAR軟件進(jìn)行序列拼接和分析，共得到病毒的全基因核苷酸序列24株，各毒株的核苷酸序列均為1767bp。 通過(guò)流行毒株的基因序列分析發(fā)現(xiàn)，本試驗(yàn)獲得的24個(gè)毒株的核苷酸序列同源性在96.0％～100％之間，各毒株的ORF

3、l同源性很高(97.1％～100％)，而ORF2的同源性相對(duì)較低(93.3％～98.6％)，病毒基因組的變異主要由ORF2基因的變異所致，兩省區(qū)的毒株在核苷酸序列的同源性上無(wú)明顯的地理差異。各毒株在基因進(jìn)化樹(shù)上同處在屬于PCV-2的分支內(nèi)，均為PCV-2，而且分處在PCV-2的兩個(gè)較大分支內(nèi)；其中GXll03、HUN321、HUN377、HUN432等4個(gè)毒株同處在PCV-2的一個(gè)小分支，其余20株處在另一個(gè)小分支；各毒株與加拿大、美國(guó)