湖南和廣西兩省區(qū)豬圓環(huán)病毒2型的PCR檢測和流行毒株全基因組的克隆測序及分析.pdf

1、豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2)是引起豬斷奶后多系統(tǒng)衰竭綜合征等相關(guān)疾病的重要病原。本文采用PCR技術(shù)，對2006-2007年我國廣西和湖南省區(qū)的PCV-2流行情況進行了檢測和病毒全基因組克隆測序及分析。 本研究對采集于我國廣西和湖南等地的301份(廣西140份，湖南161份)豬高熱綜合征病料進行了圓環(huán)病毒2型的PCR檢測，共檢出PCV-2陽性121例，其中廣西54例PCV-2陽性率為38.5％；湖南67例，陽性率為41.6％，證明

2、我國廣西湖南兩地：PCV-2感染較嚴(yán)重，PCV-2是導(dǎo)致豬高熱綜合征的一個重要病原。 本研究采用PCR技術(shù)分段擴增的方法，擴增來自廣西和湖南的PCV-2病毒基因組核苷酸序列，進行克隆測序；測序結(jié)果用DNASTAR軟件進行序列拼接和分析，共得到病毒的全基因核苷酸序列24株，各毒株的核苷酸序列均為1767bp。 通過流行毒株的基因序列分析發(fā)現(xiàn)，本試驗獲得的24個毒株的核苷酸序列同源性在96.0％～100％之間，各毒株的ORF

3、l同源性很高(97.1％～100％)，而ORF2的同源性相對較低(93.3％～98.6％)，病毒基因組的變異主要由ORF2基因的變異所致，兩省區(qū)的毒株在核苷酸序列的同源性上無明顯的地理差異。各毒株在基因進化樹上同處在屬于PCV-2的分支內(nèi)，均為PCV-2，而且分處在PCV-2的兩個較大分支內(nèi)；其中GXll03、HUN321、HUN377、HUN432等4個毒株同處在PCV-2的一個小分支，其余20株處在另一個小分支；各毒株與加拿大、美國