基于特征向量的蛋白質相互作用關系抽取.pdf

1、面對不斷指數增長的生物醫(yī)學文獻，生物醫(yī)學研究者如何從相關的文獻中自動挖掘出有價值的生物醫(yī)學知識，這是目前生物信息的熱點工作。在生命科學中，蛋白質相互作用關系起著非常特殊的作用，因此蛋白質相互作用關系抽取是生物醫(yī)學文本挖掘領域的熱點任務之一。由于生物醫(yī)學文獻自身特點的多樣性與復雜性，蛋白質相互作用關系在文獻中同樣呈現出多樣性。蛋白質相互作用關系的抽取是非常復雜的任務。
　　本文在對蛋白質相互作用關系抽取方法進一步研究的基礎上，以挖掘

2、更有效、更合理的特征為研究主線，使用支持向量機的方法對蛋白質實體對之間的相互作用關系進行抽取。本文的研究重點在于特征的設計,研究了多種語言學特征，包括了詞匯特征、詞性特征、短語特征、邏輯特征以及依存句法特征等。本文重點討論了多種不同語言學的特征對蛋白質相互作用關系抽取效果的影響，同時采用組合多種不同特征的策略來進一步改善蛋白質相互作用關系抽取的效果。
　　通過AIMed語料上的實驗，可以得到基于特征向量的方法采用了簡單有效的傳統(tǒng)特