抑制素基因作為山羊多胎性侯選基因的研究.pdf

1、產(chǎn)羔數(shù)性狀是山羊生產(chǎn)中的最重要經(jīng)濟(jì)性狀之一，很大程度地決定了整個(gè)山羊生產(chǎn)行業(yè)的經(jīng)濟(jì)利益。產(chǎn)羔數(shù)性狀遺傳力低(約0.152)，常規(guī)的選擇育種效應(yīng)有限，進(jìn)展慢。隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)理論及基因組學(xué)的發(fā)展，特別是越來(lái)越多的多胎性分子標(biāo)記在一些家畜品種中被發(fā)現(xiàn)，分子標(biāo)記輔助選擇策略及技術(shù)為提高繁殖性狀的選擇效果，加快遺傳進(jìn)展提供了新的機(jī)遇。 鑒于卵泡抑制素在母羊繁殖軸、卵巢中的重要作用，INHA、INHBB及INHBA基因被作為強(qiáng)的山羊多胎

2、性候選基因，考慮到INHBB及INHBA卷入了激活素基因構(gòu)成中，以及INHA基因的免疫效果，INHA基因被作為重點(diǎn)研究。四個(gè)山羊品種作為研究品種。初步采集具產(chǎn)羔記錄的209頭波爾山羊、53頭馬頭山羊、55頭海門(mén)山羊及63頭努比山羊作為實(shí)驗(yàn)材料。采用PCR-SSCP、PCR-RFLP等方法，研究了上述3個(gè)候選基因的多態(tài)性。采用一個(gè)固定模型統(tǒng)計(jì)每一個(gè)分型位點(diǎn)各基因型的產(chǎn)羔數(shù)最小二乘均值，然后檢驗(yàn)各基因型效應(yīng)間差異顯著性。 此外，作為

3、性狀關(guān)聯(lián)分析的輔助分析，多態(tài)的一些群體遺傳學(xué)特征被分析，包括基因型分布的群體關(guān)聯(lián)檢驗(yàn)、多態(tài)位點(diǎn)間的連鎖不平衡及可能的單倍型估計(jì)。主要結(jié)果如下： 1、在波爾山羊群體INHA基因存在12個(gè)遺傳多態(tài)，為-522C>G、-506->G、-446C>T、-155C>T、-65G>C、129G>A、567G>A、651A>G、792T>C、906C>T、911T>C、946A>C；海們山羊群體中存在除.522C>G外的其它11個(gè)；馬頭山羊中

4、選擇性鑒定了-446C>T、-65G>C、567G>A、651A>G、911T>C、946A>C；努比山羊中選擇性鑒定了-446C>T、-65G>C、567G>A、911T>C、946A>C；所有12個(gè)多態(tài)可能為這4個(gè)山羊品種間的共同多態(tài)。其中，911T>C和946A>C分別引起該處氨基酸編碼的改變，即299 Val>Ala和311Thr>Pro。在INHBB基因區(qū)域檢測(cè)到<5％的SSCP多態(tài)。在INHBA基因的區(qū)域同樣顯示小于5％的帶

5、型差異個(gè)體。 2、最小二乘分析顯示，波爾山羊群體在651A>G位點(diǎn)上基因型組間第二胎產(chǎn)羔數(shù)差異顯著(P<0.05)，馬頭山羊及努比山羊群體在-446C>T位點(diǎn)上基因型組間第二胎產(chǎn)羔數(shù)均差異顯著(P<0.05)。馬頭山羊群體在位點(diǎn)946A>C基因型組間第二胎產(chǎn)羔數(shù)差異極顯著(P<0.01)。 3、卡方檢驗(yàn)表明，波爾山羊群體樣本在-446C>T、 651A>G和792T>C三個(gè)位點(diǎn)上及海門(mén)山羊群體樣本在-155C>T、129

6、G>A和651A>G不處于哈代溫伯格平衡(P<0.05)；在所發(fā)現(xiàn)的多態(tài)位點(diǎn)中，除-506->G、-155C>T和651A>G外的其它位點(diǎn)的基因型頻率分布均與研究的群體關(guān)聯(lián)。 4、4個(gè)中外山羊群體樣本在INHA基因的外顯子Ⅱ存在一個(gè)兩位點(diǎn)的完全連鎖不平衡；波爾山羊和海門(mén)山羊在INHA基因的外顯子Ⅰ中存在另一個(gè)強(qiáng)的兩位點(diǎn)連鎖不平衡。 5、在波爾山羊和海門(mén)山羊兩個(gè)群體樣本中，在INHA基因外顯子的1的-155、-65和129

7、兩兩位點(diǎn)之間，以及-446與-65位點(diǎn)之間，在外顯子2的651和792，792和906，792和911，792和946，906和946，以及911和946位點(diǎn)間，跨內(nèi)含子的-506與567，-155與567，以及-65與567位點(diǎn)間發(fā)生M<,1>M<,1>M<,2>M<,2>、M<,1>M<,1>W<,2>M<,2>及W<,1>M<,1>M<,2>M<,2>三個(gè)特定的兩位點(diǎn)組合基因型的貧乏甚至缺失。這個(gè)現(xiàn)象暗示含兩個(gè)共線(xiàn)“突變型等位基因