三苯甲烷類染料與不同結構的DNA的相互作用的研究.pdf

1、易形成G-四聯(lián)體結構的富G核酸序列在生物的重要領域很常見?？紤]到這些序列的大部分是和它們的互補鏈共存的，發(fā)展一種可以區(qū)分G-四聯(lián)體和雙鏈結構且判斷雙鏈和G-四聯(lián)體的競爭能力的生物傳感器將會引起很大注意。本論文考察了三苯甲烷類染料(孔雀石綠(MG))和結晶紫(CV))和G-四聯(lián)體、雙鏈和單鏈DNA的相互作用后熒光和熒光共振能量轉移熒光光譜。發(fā)現(xiàn)結晶紫或孔雀石綠熒光光譜和熒光共振能量轉移熒光光譜能很好的區(qū)分四聯(lián)體和雙鏈、單鏈DNA。另外，用

2、G-四聯(lián)體滴定孔雀石綠和結晶紫能量共振轉移熒光可以計算結晶紫和G-四聯(lián)體的化學計量比。通過G-四聯(lián)體的互補鏈富C鏈滴定G-四聯(lián)體-結晶紫配合物的熒光，可以測量計算在互補鏈存在下富G核酸序列的四聯(lián)體結構形成存在的百分數(shù)。這個研究提供了一個簡單的區(qū)分G-四聯(lián)體和雙鏈、單鏈DNA和在互補鏈富C-核酸存在下計算G-四聯(lián)體百分數(shù)的方法。
　　 此外，本論文還考察了結晶紫區(qū)分平行和反平行G-四聯(lián)體結構的能力。結晶紫連結到反平行G-四聯(lián)體上可

3、以使它的熒光強度增加到一個高水平，因為G-四聯(lián)體末端環(huán)(end loops)的存在能夠對結合在四聯(lián)體上的CV提供有效的保護作用，通過阻礙進行水分子與CV的接近而使CV的熒光信號顯著增強。在平行G-四聯(lián)體中由于側環(huán)的存在不能提供這樣的保護，使結晶紫/G-四聯(lián)體配合物熒光在G-四聯(lián)體形成平行結構時的熒光明顯的比在形成反平行結構時熒光弱。因此結晶紫可以發(fā)展成一種區(qū)分平行和反平行結構G-四聯(lián)體和檢測G-四聯(lián)體相互轉化的結構的靈敏的熒光傳感器，并