刺參遺傳多樣性的微衛(wèi)星及RAPD分析.pdf

1、本研究以煙臺(tái)、蓬萊、威海、大連4個(gè)地理種群及養(yǎng)殖和自然群體的仿刺參(又稱刺參)為研究對(duì)象，采用RAPD和SSR兩種分子標(biāo)記對(duì)四個(gè)群體的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。分析了刺參養(yǎng)殖群體和自然群體之間的遺傳變異，以及四群體之間的遺傳分化。主要結(jié)果如下： 1.用經(jīng)過篩選的9個(gè)微衛(wèi)星座位對(duì)刺參養(yǎng)殖群體和自然群體進(jìn)行擴(kuò)增，每個(gè)座位檢測(cè)到的等位基因數(shù)為4～12個(gè)。自然和養(yǎng)殖群體中，有效等位基因平均數(shù)分別為6.5556和5.8889，期望雜合度的平均值

2、分別為0.7641和0.6941，觀測(cè)雜合度的平均值分別為0.6416和0.5635。根據(jù)群體中各座位等位基因頻率計(jì)算出兩群體間的遺傳相似度為0.7970、遺傳距離為0.2269。對(duì)兩群體進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，自然群體在位點(diǎn)Psj1828、Psj2022、Psj2642，養(yǎng)殖群體在位點(diǎn)Psj2022、Psj2031、Psj2409、Psj2642、Psj2889都出現(xiàn)了雜合子缺失現(xiàn)象，特別是養(yǎng)殖群體在位點(diǎn)Psj2

3、022，其Hardy-weinberg遺傳偏離指數(shù)達(dá)0.5164。結(jié)果表明，與自然群體相比，刺參養(yǎng)殖群體存在雜合度降低，遺傳多樣性下降的現(xiàn)象，這可能與人工養(yǎng)殖過程中，群體較小，引起近交機(jī)會(huì)增加有關(guān)。應(yīng)制定相應(yīng)的漁業(yè)生產(chǎn)和管理措施加以保護(hù)，以使刺參養(yǎng)殖持續(xù)健康發(fā)展。 2.運(yùn)用微衛(wèi)星DNA技術(shù)對(duì)刺參煙臺(tái)群體、威海群體、大連群體的3個(gè)野生群進(jìn)行了遺傳分析。對(duì)9個(gè)基因位點(diǎn)進(jìn)行了PCR擴(kuò)增，共獲得了59個(gè)等位基因。評(píng)估了9對(duì)微衛(wèi)星引物的多

4、態(tài)信息含量(PIC)，范圍在0.5129-0.8794之間。結(jié)果表明：3個(gè)野生群體的平均雜合度觀測(cè)值分別為0.6416、0.6595、0.5824，平均雜合度期望值分別為0.7641、O.7161、0.7364；在Hardy-Weinberg平衡條件下，進(jìn)行了P檢驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)3個(gè)群體均有位點(diǎn)發(fā)生了顯著偏離；對(duì)3個(gè)群體進(jìn)行了配對(duì)Fst值計(jì)算，發(fā)現(xiàn)3個(gè)群體之間遺傳分化較弱。從變異貢獻(xiàn)率來看，95.68％的變異來自個(gè)體之間，4.32％的變異來自群

5、體之間。經(jīng)過UPGMA聚類，發(fā)現(xiàn)威海群體和大連群體之間親緣關(guān)系較近，煙臺(tái)群體與前兩群體親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。 3.采用RAPD技術(shù)對(duì)煙臺(tái)(YT)，蓬萊(PL)，威海(WH)，大連(DL)沿海天然以及養(yǎng)殖刺參的遺傳多樣性進(jìn)行了研究。實(shí)驗(yàn)用20條隨機(jī)引物用于四群體的遺傳多樣性分析。結(jié)果表明：四群體多態(tài)位點(diǎn)比例和平均遺傳雜合度分別為65.71％、57.57％、62.96％、65.51％和0.5833、0.5091、0.5546、0.5318