奶牛分子系譜鑒定的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及其與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、奶牛個(gè)體系譜錯(cuò)誤或丟失會(huì)導(dǎo)致近交衰退和遺傳多樣性減弱，延緩奶牛遺傳進(jìn)展，對(duì)奶牛選種選配和遺傳改良工作造成重大影響。為優(yōu)化前人研究的微衛(wèi)星位點(diǎn)親子鑒定技術(shù)，嘗試使之能有效的應(yīng)用于奶牛群體親子鑒定與系譜構(gòu)建，本研究從ISAG中初步篩選了18個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)，從佳寶一牧奶牛場(chǎng)采集300頭荷斯坦奶牛血液及毛囊樣品，9頭種公牛凍精樣品，經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)，篩選了8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)(TGLA122、TGLA227、BMC1207、IN

2、RA134、INRA037、BM103、MB026和BP7)用于荷斯坦奶牛親子鑒定。運(yùn)用Cervus3.0軟件對(duì)個(gè)體進(jìn)行微衛(wèi)星基因型的檢測(cè)，計(jì)算了8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)(nA)、等位基因頻率、多態(tài)性信息含量(PIC)、群體觀察雜合度(Ho)、期望雜合度(He)，并做了Hardy-Weinberg平衡檢測(cè)，微衛(wèi)星位點(diǎn)單個(gè)位點(diǎn)排除概率(PE)，多個(gè)位點(diǎn)結(jié)合排除概率(CPE)，運(yùn)用SAS8.2中的GLM程序?qū)?個(gè)生產(chǎn)性狀和8個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行單位

3、點(diǎn)線性分析，得到如下結(jié)果：
　　(1)8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性各異，等位基因數(shù)在7~19個(gè)之間，平均等位基因數(shù)為14.63。其中微衛(wèi)星位點(diǎn)TGLA227、TGLA122和INRA134有19個(gè)等位基因，位點(diǎn)BMC1207有18個(gè)等位基因，均表現(xiàn)出很高的多態(tài)性；微衛(wèi)星位點(diǎn)BP7有7個(gè)等位基因，在8個(gè)位點(diǎn)中多態(tài)性最低。
　　(2)8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)信息含量(PIC)和期望雜合度(He)較高，8個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)信息含量在0.520(BM

4、103)~0.866(TGLA227)之間，平均為0.747。PIC值大于0.5則為高多態(tài)性位點(diǎn)，由此可見8個(gè)位點(diǎn)均為高多態(tài)性位點(diǎn)。8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的期望雜合度(He)在0.553(MB026)~0.880(TGLA227)之間，平均期望雜合度為0.718，進(jìn)一步說(shuō)明8個(gè)位點(diǎn)具有較高的多態(tài)性。
　　(3)8個(gè)位點(diǎn)的單親排除概率從0.181(MB026)到0.601(TGLA227)之間變化，其中大于0.5的位點(diǎn)有TGLA227、TG

5、LA122和BMC1207，在雙親未知的情況下，8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的結(jié)合排除概率達(dá)到99％，在一個(gè)親本基因型已知的情況下，8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的結(jié)合排除概率大于99%，因此初步確定微衛(wèi)星位點(diǎn)TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103、INRA037、INRA134、BP7和MB026可用于中國(guó)荷斯坦奶牛的親權(quán)鑒定體系。
　　(4)通過(guò)對(duì)6個(gè)生產(chǎn)性狀和8個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行單位點(diǎn)線性分析得出，微衛(wèi)星位點(diǎn)BP7對(duì)乳蛋白量具有顯著影響(P＜