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文檔簡介
1、奶牛個體系譜錯誤或丟失會導致近交衰退和遺傳多樣性減弱,延緩奶牛遺傳進展,對奶牛選種選配和遺傳改良工作造成重大影響。為優(yōu)化前人研究的微衛(wèi)星位點親子鑒定技術,嘗試使之能有效的應用于奶牛群體親子鑒定與系譜構建,本研究從ISAG中初步篩選了18個微衛(wèi)星位點,從佳寶一牧奶牛場采集300頭荷斯坦奶牛血液及毛囊樣品,9頭種公牛凍精樣品,經瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,篩選了8個微衛(wèi)星位點(TGLA122、TGLA227、BMC1207、IN
2、RA134、INRA037、BM103、MB026和BP7)用于荷斯坦奶牛親子鑒定。運用Cervus3.0軟件對個體進行微衛(wèi)星基因型的檢測,計算了8個微衛(wèi)星位點的等位基因數(nA)、等位基因頻率、多態(tài)性信息含量(PIC)、群體觀察雜合度(Ho)、期望雜合度(He),并做了Hardy-Weinberg平衡檢測,微衛(wèi)星位點單個位點排除概率(PE),多個位點結合排除概率(CPE),運用SAS8.2中的GLM程序對6個生產性狀和8個位點進行單位
3、點線性分析,得到如下結果:
(1)8個微衛(wèi)星位點多態(tài)性各異,等位基因數在7~19個之間,平均等位基因數為14.63。其中微衛(wèi)星位點TGLA227、TGLA122和INRA134有19個等位基因,位點BMC1207有18個等位基因,均表現出很高的多態(tài)性;微衛(wèi)星位點BP7有7個等位基因,在8個位點中多態(tài)性最低。
(2)8個微衛(wèi)星位點的多態(tài)信息含量(PIC)和期望雜合度(He)較高,8個位點的多態(tài)信息含量在0.520(BM
4、103)~0.866(TGLA227)之間,平均為0.747。PIC值大于0.5則為高多態(tài)性位點,由此可見8個位點均為高多態(tài)性位點。8個微衛(wèi)星位點的期望雜合度(He)在0.553(MB026)~0.880(TGLA227)之間,平均期望雜合度為0.718,進一步說明8個位點具有較高的多態(tài)性。
(3)8個位點的單親排除概率從0.181(MB026)到0.601(TGLA227)之間變化,其中大于0.5的位點有TGLA227、TG
5、LA122和BMC1207,在雙親未知的情況下,8個微衛(wèi)星位點的結合排除概率達到99%,在一個親本基因型已知的情況下,8個微衛(wèi)星位點的結合排除概率大于99%,因此初步確定微衛(wèi)星位點TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103、INRA037、INRA134、BP7和MB026可用于中國荷斯坦奶牛的親權鑒定體系。
(4)通過對6個生產性狀和8個位點進行單位點線性分析得出,微衛(wèi)星位點BP7對乳蛋白量具有顯著影響(P<
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