XBP1基因與中國漢族人白癜風(fēng)的相關(guān)性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、背景:白癜風(fēng)是一種皮膚科常見復(fù)雜疾病,人群中患病率約為0.1%-2%。盡管白癜風(fēng)的病因和發(fā)病機(jī)制尚不明了,近年來的大量研究表明遺傳和免疫因素在白癜風(fēng)發(fā)病中起到重要作用。目前已有文獻(xiàn)報道了6個白癜風(fēng)易感位點(diǎn),相當(dāng)多的候選基因研究亦成為白癜風(fēng)遺傳學(xué)研究的熱點(diǎn)。在前期研究中,本課題組對143個白癜風(fēng)家系共736個體(包括369名患者和367名無白癜風(fēng)表型的正常對照)進(jìn)行全基因組掃描連鎖分析,證實了染色體22q12區(qū)域存在中國漢族人白癜風(fēng)的易感

2、位點(diǎn)。X盒結(jié)合蛋白(XBP1)基因位于該定位區(qū)域,是一種重要的轉(zhuǎn)錄因子。X盒為HLA II類基因啟動子區(qū)域的一個調(diào)控因子,與正向轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合后,增強(qiáng)下游基因的表達(dá),而XBP1編碼的蛋白就是結(jié)合于X盒的這種轉(zhuǎn)錄因子,HLA-DR及DP的表達(dá)在很大程度上受XBP1基因的影響。結(jié)合白癜風(fēng)與HLA自身免疫的相關(guān)性,該基因可以看作是白癜風(fēng)的一個非常重要的功能候選基因。
   目的:通過一系列的遺傳和功能研究系統(tǒng)性探討位于染色體22q12區(qū)

3、域的XBP1基因與中國漢族人群白癜風(fēng)發(fā)病的相關(guān)性。
   方法:首先在319個中國漢族白癜風(fēng)患者(有家族史)及294個正常對照中,對XBP1基因的啟動子區(qū)域、外顯子、外顯子和內(nèi)含子交界區(qū)域測序以及部分內(nèi)含子區(qū)域直接測序,進(jìn)行SNP篩查;然后分別對另外兩個獨(dú)立樣本(365病例/404對照和1402病例/1288對照,包括94個trios)進(jìn)行大規(guī)?;蚍中鸵则炞C初期得到的位于啟動子區(qū)域的一個SNP位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)性;并采用序列特異性引物

4、-多聚酶鏈反應(yīng)法檢測了HLA-DRB4*01,DRB1*04,DRB1*07,DRB1*12的基因頻率分布,應(yīng)用Logistic回歸進(jìn)行兩個位點(diǎn)的交互作用分析;構(gòu)建XBP1基因該SNP位點(diǎn)的重組質(zhì)粒的熒光素酶雙報告基因載體,轉(zhuǎn)染人HaCat和Mel-RM細(xì)胞,進(jìn)行瞬時表達(dá)分析,以檢測此多態(tài)對基因表達(dá)調(diào)控作用;分別采用實時定量PCR和免疫組化法從mRNA和蛋白水平分別檢測XBP1基因在白癜風(fēng)患者皮損和非皮損中是否存在表達(dá)差異。
  

5、 結(jié)果:①在319個白癜風(fēng)患者和294個正常對照中對XBP1基因進(jìn)行測序,共檢出34個SNPs,其中位于啟動子區(qū)域的SNP rs2269577等位基因頻率在白癜風(fēng)病例和對照間存在顯著性差異(p_trend=0.007,OR=1.36,95%CI=1.09–1.71);②在另外的365個白癜風(fēng)患者和404個正常對照進(jìn)行測序,結(jié)果仍提示該SNP位點(diǎn)有顯著意義(p_trend=0.008,OR=1.31,95%CI=1.07–1.59);③

6、繼續(xù)擴(kuò)大樣本量,在另外的獨(dú)立樣本(1402病例/1288對照,包括94個trios)的SNP關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果進(jìn)一步證實rs2269577位點(diǎn)的等位基因頻率在白癜風(fēng)患者和正常對照間存在顯著性差異(p=0.003,OR=1.18,95%CI=1.06–1.32; TDT檢驗p=0.005,OR=1.93,95%CI=1.21–3.07);合并分析全部2086例患者和1986例對照,所得結(jié)果顯示rs2269577等位基因頻率在病例和對照組間存在

7、極顯著相關(guān)(p_trend=2.94×10-6,OR=1.23,95%CI=1.13–1.35);④在對1755個病例和1742個對照的HLA分型結(jié)果中發(fā)現(xiàn),HLA-DRB1*07與白癜風(fēng)存在顯著相關(guān)(p=4.53×10-21,OR=1.98,95%CI=1.72-2.29),并與rs2269577存在交互作用(p=0.033);⑤熒光素酶報告基因表達(dá)結(jié)果顯示rs2269577 C等位基因可以增強(qiáng)XBP1啟動子的轉(zhuǎn)錄活性,含有C等位基因

8、的質(zhì)粒所誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄活性明顯高于含有G等位基因所誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄活性(P<0.05);⑥對白癜風(fēng)患者皮損和非皮損的XBP1 mRNA和蛋白水平的檢測均提示白癜風(fēng)皮損中XBP1的表達(dá)增高,且攜帶危險等位基因C的白癜風(fēng)皮損表達(dá)比未攜帶等位基因C的皮損表達(dá)亦有增高趨勢。
   結(jié)論:XBP1基因啟動子區(qū)域的多態(tài)位點(diǎn)rs2269577與中國漢族人群白癜風(fēng)存在顯著相關(guān)性。其危險等位基因C可能通過提高XBP基因的轉(zhuǎn)錄活性,促進(jìn)基因的表達(dá)從而參與白癜

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