XBP1基因與中國漢族人白癜風的相關性研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩125頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、背景:白癜風是一種皮膚科常見復雜疾病,人群中患病率約為0.1%-2%。盡管白癜風的病因和發(fā)病機制尚不明了,近年來的大量研究表明遺傳和免疫因素在白癜風發(fā)病中起到重要作用。目前已有文獻報道了6個白癜風易感位點,相當多的候選基因研究亦成為白癜風遺傳學研究的熱點。在前期研究中,本課題組對143個白癜風家系共736個體(包括369名患者和367名無白癜風表型的正常對照)進行全基因組掃描連鎖分析,證實了染色體22q12區(qū)域存在中國漢族人白癜風的易感

2、位點。X盒結合蛋白(XBP1)基因位于該定位區(qū)域,是一種重要的轉錄因子。X盒為HLA II類基因啟動子區(qū)域的一個調控因子,與正向轉錄因子結合后,增強下游基因的表達,而XBP1編碼的蛋白就是結合于X盒的這種轉錄因子,HLA-DR及DP的表達在很大程度上受XBP1基因的影響。結合白癜風與HLA自身免疫的相關性,該基因可以看作是白癜風的一個非常重要的功能候選基因。
   目的:通過一系列的遺傳和功能研究系統(tǒng)性探討位于染色體22q12區(qū)

3、域的XBP1基因與中國漢族人群白癜風發(fā)病的相關性。
   方法:首先在319個中國漢族白癜風患者(有家族史)及294個正常對照中,對XBP1基因的啟動子區(qū)域、外顯子、外顯子和內含子交界區(qū)域測序以及部分內含子區(qū)域直接測序,進行SNP篩查;然后分別對另外兩個獨立樣本(365病例/404對照和1402病例/1288對照,包括94個trios)進行大規(guī)?;蚍中鸵则炞C初期得到的位于啟動子區(qū)域的一個SNP位點的關聯(lián)性;并采用序列特異性引物

4、-多聚酶鏈反應法檢測了HLA-DRB4*01,DRB1*04,DRB1*07,DRB1*12的基因頻率分布,應用Logistic回歸進行兩個位點的交互作用分析;構建XBP1基因該SNP位點的重組質粒的熒光素酶雙報告基因載體,轉染人HaCat和Mel-RM細胞,進行瞬時表達分析,以檢測此多態(tài)對基因表達調控作用;分別采用實時定量PCR和免疫組化法從mRNA和蛋白水平分別檢測XBP1基因在白癜風患者皮損和非皮損中是否存在表達差異。
  

5、 結果:①在319個白癜風患者和294個正常對照中對XBP1基因進行測序,共檢出34個SNPs,其中位于啟動子區(qū)域的SNP rs2269577等位基因頻率在白癜風病例和對照間存在顯著性差異(p_trend=0.007,OR=1.36,95%CI=1.09–1.71);②在另外的365個白癜風患者和404個正常對照進行測序,結果仍提示該SNP位點有顯著意義(p_trend=0.008,OR=1.31,95%CI=1.07–1.59);③

6、繼續(xù)擴大樣本量,在另外的獨立樣本(1402病例/1288對照,包括94個trios)的SNP關聯(lián)分析,結果進一步證實rs2269577位點的等位基因頻率在白癜風患者和正常對照間存在顯著性差異(p=0.003,OR=1.18,95%CI=1.06–1.32; TDT檢驗p=0.005,OR=1.93,95%CI=1.21–3.07);合并分析全部2086例患者和1986例對照,所得結果顯示rs2269577等位基因頻率在病例和對照組間存在

7、極顯著相關(p_trend=2.94×10-6,OR=1.23,95%CI=1.13–1.35);④在對1755個病例和1742個對照的HLA分型結果中發(fā)現(xiàn),HLA-DRB1*07與白癜風存在顯著相關(p=4.53×10-21,OR=1.98,95%CI=1.72-2.29),并與rs2269577存在交互作用(p=0.033);⑤熒光素酶報告基因表達結果顯示rs2269577 C等位基因可以增強XBP1啟動子的轉錄活性,含有C等位基因

8、的質粒所誘導的轉錄活性明顯高于含有G等位基因所誘導的轉錄活性(P<0.05);⑥對白癜風患者皮損和非皮損的XBP1 mRNA和蛋白水平的檢測均提示白癜風皮損中XBP1的表達增高,且攜帶危險等位基因C的白癜風皮損表達比未攜帶等位基因C的皮損表達亦有增高趨勢。
   結論:XBP1基因啟動子區(qū)域的多態(tài)位點rs2269577與中國漢族人群白癜風存在顯著相關性。其危險等位基因C可能通過提高XBP基因的轉錄活性,促進基因的表達從而參與白癜

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論