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文檔簡介
1、研究目的:
喉鱗狀細(xì)胞癌(喉鱗癌)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的早期發(fā)現(xiàn)對喉鱗癌的治療及預(yù)后至關(guān)重要,而目前人們對于相關(guān)的分子機(jī)理及分子標(biāo)志的認(rèn)識尚有限。本研究應(yīng)用基因芯片技術(shù),研究喉鱗狀細(xì)胞癌隱匿性頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)的microRNA(miRNA)表達(dá)譜,篩選cN0期隱匿性頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陽性的喉鱗癌及無轉(zhuǎn)移者癌組織中差異表達(dá)的miRNA,為深入理解喉鱗癌發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的分子機(jī)理,尋找相應(yīng)的分子生物學(xué)標(biāo)志提供理論基礎(chǔ)和研究依據(jù)。
研究方
2、法:
選取cN0期原發(fā)喉鱗狀細(xì)胞癌患者6例,其中3例術(shù)后病理證實(shí)伴有頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,3例無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,手術(shù)切除新鮮癌組織及對應(yīng)癌旁正常黏膜組織標(biāo)本,Trizol mirVana?miRNA Isolation Kit試劑盒提取總RNA,經(jīng)Agilent Bioanalyzer2100電泳質(zhì)檢達(dá)芯片雜交質(zhì)控要求后,采用Agilent Human miRNA Microarray version2 Kit,P/N G4470B芯片進(jìn)
3、行RNA樣品標(biāo)記及雜交實(shí)驗,洗滌后的芯片經(jīng)Agilent芯片激光掃描儀掃描后采用Feature Extraction軟件提取數(shù)據(jù),GeneSpring軟件分析數(shù)據(jù),以t-test檢驗篩選在轉(zhuǎn)移組和無轉(zhuǎn)移組中差異表達(dá)的miRNA(以P值<0.05和FC值>2為條件)。
研究結(jié)果:
共有13個miRNA在隱匿性轉(zhuǎn)移性喉鱗狀細(xì)胞癌中存在差異表達(dá),相對于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組,在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組中有6個表達(dá)顯著上調(diào)(FC>2,P<0.
4、05),包括:hsa-miR-5194,hsa-miR-1305,hsa-miR-6717-5p,hsa-miR-1260b,hsa-miR-6131,hsa-miR-1288,其中hsa-miR-1288上調(diào)3倍以上;而表達(dá)明顯下調(diào)(FC<0.5,log2<-1,P<0.05)的miRNA有7個,分別是:hsa-miR-31-3p,hsa-miR-144-5p,hsa-miR-4728-3p,hsa-miR-5196-5p,hsa-m
5、iR-149-5p,hsa-miR-486-5p,hsa-miR-4417。
研究結(jié)論:
基因芯片技術(shù)是一種快捷有效的高通量分析喉鱗狀細(xì)胞癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)miRNA表達(dá)譜的檢測方法。通過miRNA芯片分析,初步建立起轉(zhuǎn)移性喉鱗狀細(xì)胞癌差異性miRNA表達(dá)譜,共有13個miRNA:相對于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組,6個miRNA在伴有頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的喉鱗狀細(xì)胞癌組織中表達(dá)水平顯著上調(diào),7個miRNA的表達(dá)水平顯著下調(diào)。這13個差異表
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