香豬鼻腔細(xì)菌和真菌群落分析.pdf

1、微生態(tài)學(xué)的理論與實(shí)踐推動(dòng)著人們對(duì)呼吸道中固有微生物群落的研究與認(rèn)識(shí)。上呼吸道的鼻腔黏膜表面和其他與外界相通的黏膜組織一樣，定植著結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定和組成十分復(fù)雜的微生物菌群。鼻腔由于受到組織結(jié)構(gòu)、生理功能以及外界諸多因素的影響，構(gòu)成了有別于呼吸道其他部位的獨(dú)特生態(tài)環(huán)境。本研究采用PCR-DGGE和Real-time PCR的方法，結(jié)合Quantity one圖象分析軟件對(duì)DGGE圖譜進(jìn)行分析和 UPGMA進(jìn)行聚類分析，并計(jì)算多樣性指數(shù)（香濃指

2、數(shù)、均勻性指數(shù)、豐富度指數(shù)和優(yōu)勢(shì)度指數(shù)）。數(shù)據(jù)使用SPSS19.0進(jìn)行分析來(lái)測(cè)定群落結(jié)構(gòu)之間的相關(guān)性。得到以下結(jié)果：
　　1.通過(guò)DNA酶結(jié)合CTAB法提取DNA更能客觀反映鼻腔黏膜上定植的微生物多樣性的真實(shí)情況；
　　2.菌群指紋圖譜中反應(yīng)了香豬鼻腔內(nèi)微生物菌群的動(dòng)態(tài)變化情況，不同生長(zhǎng)階段的香豬鼻腔真菌、細(xì)菌菌群組成穩(wěn)定差異不顯著（P>0.05)，同時(shí)感染組與健康組香豬鼻腔內(nèi)真菌和細(xì)菌群落組成差異不顯著（P>0.05).<

3、br>　　3．處于微生物定植高峰期的二月齡香豬鼻腔黏膜內(nèi)，細(xì)菌群落多樣性指數(shù)明顯高于其它月齡；穩(wěn)定期的五月齡香豬，鼻腔細(xì)菌群落多樣性指數(shù)最低；
　　4. DGGE圖譜中檢測(cè)到大量未培養(yǎng)真菌和細(xì)菌，也檢測(cè)到莫拉克斯氏菌屬（Moraxella sp.）、肺炎鏈球菌（Streptococcus pneumoniae）、副豬嗜血桿菌屬(H. parasuis)、金黃色釀膿葡萄球菌屬（Staphylococcus aureus）、流感嗜血桿

4、菌屬（Haemophilus influenza）、白色念珠菌屬（Candida.sp）等常見(jiàn)的條件致病性微生物。
　　5.群落測(cè)序結(jié)果中的微生物主要分為六大類：酵母亞門（Saccharomycotina）、子囊菌門（ Ascomycota）、放線菌門（ Actinobacteria）、盤菌亞門（Pezizomycotina）、厚壁菌門（Firmicutes）、變形菌門（Proteobacteria）。
　　6.感染組中香豬