小麥病程相關(guān)蛋白類甜蛋白的生物信息分析.pdf

1、植物病程相關(guān)蛋白在植物抗病反應(yīng)中具有重要作用，類甜蛋白是植物病程蛋白的主要成員之一，它在離體條件下具有很強的抑菌抗菌活性，將該蛋白導(dǎo)入植物體內(nèi)可明顯提高植物的抗病性，因而該類蛋白在植物與病原物的相互作用研究中得到了關(guān)注。小麥白粉病最為有效的防治方法仍是培育抗性品種，因而針對小麥白粉病的抗性相關(guān)蛋白的研究顯得十分重要。小麥類甜蛋白的表達在小麥對白粉病的抗性中起著重要作用，因而有必要從蛋白序列上探討其結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系。本文利用已報道的小麥白

2、粉病誘導(dǎo)表達的類甜蛋白基因TaTLP1序列，通過生物信息學(xué)對該類甜蛋白基本性質(zhì)和高級結(jié)構(gòu)進行了預(yù)測分析，主要結(jié)果如下：
　　1、小麥類甜蛋白（TaTLP1）基因表達173個氨基酸，具有保守的THN結(jié)構(gòu)域，但明顯不同于已有結(jié)構(gòu)報道的類甜蛋白，在半胱氨酸數(shù)量上有較大的變異，其可能與特定的抗菌功能相關(guān)。同源性比較發(fā)現(xiàn)，其與小麥族植物中的大麥和黑麥TLP蛋白最為接近。
　　2、通過Kyte& Doolittle算法，Hopp& Wo

3、ods算法以及Vector NTI方法對該TaTLP1蛋白的疏水性，跨膜區(qū)和前導(dǎo)肽等基本性質(zhì)進行了預(yù)測分析，發(fā)現(xiàn)此蛋白除0-20位左右氨基酸為疏水的，其余部分都具有很強的親水性，推斷其0-20位為信號肽，該蛋白可能為一種分泌蛋白。
　　3、應(yīng)用Chou& Fasman算法，GOR算法和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法分析了該蛋白的二級結(jié)構(gòu)，基本推斷出TaTLP1蛋白分子除導(dǎo)引肽為α螺旋外，主要由β折疊組成，并且進一步應(yīng)用常用的同源模建法，串線法以及從