IgA腎病臨床危險因素和基因組學(xué)研究.pdf

1、IgA腎病(IgAN)是亞洲人終末期腎臟病(ESRD)的常見原因，屬復(fù)雜性疾病，臨床表現(xiàn)及預(yù)后差異很大。本研究目的：1）通過對大組中國人IgAN患者的研究，建立新的臨床風(fēng)險模型，有效預(yù)測IgAN患者預(yù)后(ESRD);2)通過對大組中國、歐洲和北美人IgAN患者進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)，尋找到新的IgAN易感基因及位點；3）通過拷貝數(shù)變異(CNV)研究，試圖發(fā)現(xiàn)GWAS研究所定位易感位點的功能變異。我們致力于建立全新的遺傳易感性模

2、型，增進(jìn)對該病的了解。
　　 首先，本研究回顧性分析經(jīng)腎活檢確診的619例IgAN患者，以ESRD為研究終點，記錄基線及隨訪臨床指標(biāo)，平均隨訪時間為41.3個月。隨訪期間共67位患者達(dá)到研究終點需行腎臟替代治療。我們建立Cox比例風(fēng)險模型，經(jīng)完全校正后，發(fā)現(xiàn)五個基線變量為發(fā)生ESRD的獨立危險因素，這些危險因素包括：評估腎小球濾過率(eGFR)[HR=0.96(0.95-0.97)]，血清白蛋白[HR=0.48(0.33-0.7

3、2)]，血紅蛋白[HR=0.80(0.72-0.89)]，收縮壓[HR=1.02(1.00-1.03)]以及Haas分型[HR=4.54(1.30-15.90)]?；谶@5個變量，我們建立了一個計算臨床危險評分的模型。此危險評分可以解釋研究終點差異的23％，進(jìn)一步應(yīng)用受試者工作特征曲線(ROC)比較該危險評分與之前推薦應(yīng)用的危險評分相比較，發(fā)現(xiàn)本研究建立的危險評分能更好預(yù)測不同時間點(24個月、60個月、和120個月)患者的預(yù)后( ES

4、RD)?？傊?，本研究結(jié)果顯示基礎(chǔ)eGFR較低、血紅蛋白較低、血清白蛋白較低、基礎(chǔ)收縮壓較高和病理損害較嚴(yán)重的IgA患者進(jìn)展為ESRD的風(fēng)險高?；谝陨衔鍌€基礎(chǔ)變量建立新的風(fēng)險評分系統(tǒng)為對IgAN患者進(jìn)行風(fēng)險分層提供了一個簡單的方法。
　　 其次，我們對大組中國、歐洲和北美人IgaN進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)。本研究第二部分入選IgAN患者及健康人共5966人，其中發(fā)現(xiàn)組標(biāo)本來自中國北方（北京），包括1194例IgAN患者和

5、902例健康人，驗證組分別來自中國南方（上海）（740例患者，750例健康人），歐洲和北美（1273例患者，1201例健康人）。結(jié)果顯示，共5個獨立易感位點與IgAN顯著相關(guān)，其中3個在主要組織相容性復(fù)合物(MHC)區(qū)域（p-values:1.59 x I0-26,-4.84 x10.9，OR=0.63-0.80），1個位于1q32（包含一個常見缺失CFHRI3），一個在22q12。結(jié)合這5個易感位點建立遺傳易感模型，共可解釋4-7%的

6、疾病發(fā)生，高風(fēng)險較低風(fēng)險個體IgAN發(fā)病率可增高10倍。此外，這些IgAN危險性等位基因的頻率在亞洲人最高、歐洲人其次、非洲人最低，與該病的發(fā)病率平行，這一發(fā)現(xiàn)提示存在復(fù)雜的自然選擇壓力。
　　 因為GWAS發(fā)現(xiàn)在1號染色體1q32補(bǔ)體H因子(CFH)所在區(qū)域與IgA腎病(IgAN)呈現(xiàn)明顯相關(guān)性。該區(qū)域的最強(qiáng)信號來自rS6677604，與一個常見的包含CFHR1和CFHR3的染色體缺失(CFHR1，3a)顯著相關(guān)。本研究第三部

7、分目的為(1)通過直接檢測CFHR1,3研究該染色體缺失是否是CFH區(qū)域與IgAN關(guān)聯(lián)的功能變異：(2)尋找該區(qū)域是否存在其他與IgAN相關(guān)的罕見變異。本研究納入1929經(jīng)腎活檢確診的原發(fā)性IgAN和1652例健康人，所有研究對象均為中國漢族人。我們首先對該區(qū)域的6個基因（CFH，CFHRl-5）進(jìn)行編碼區(qū)測序，未發(fā)現(xiàn)有意義的變異，其次通過多重連接依賴的探針擴(kuò)增(MLPA)技術(shù)和定量PCR(qPCR)方法對所有研究對象進(jìn)行拷貝數(shù)變異(C

8、NV)的檢測，應(yīng)用PLINK v1.07和UNPHASED3.1.3對CNV結(jié)果進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。我們發(fā)現(xiàn)，CFHR1，3A和rs6677604變異存在高度連鎖不平衡(r2=0．90，D’=0.98)，二者均與IgAN存在明確的相關(guān)性(rs6677604：OR=0.60，p=1.510-6；CFHR1，3A：OR=0.56，p=4.6*10"s)。當(dāng)我們以rs6677604為協(xié)變量作條件回歸，CFHR1，3A仍然具有獨立的IgAN保護(hù)作用(

9、OR=0.44，95%CI:0.24-0.83，p=0.01)。相反，當(dāng)我們以CFHR1,3為協(xié)變量作條件回歸，rs6677604的顯著性則消失(OR=1.23，P=0.28)。此外，我們還發(fā)現(xiàn)了3個罕見的單基因拷貝數(shù)變異(CFHR3A，CFHRIA和CFHRI duplication，freq=0.6-2%)，但這些CNV與IgAN的發(fā)病無相關(guān)性。由于我們發(fā)現(xiàn)CFHR1，3可解釋rs6677604與IgAN的相關(guān)性，強(qiáng)烈提示該染色體缺