菊芋果聚糖合成酶基因克隆與表達(dá)分析.pdf
菊芋HELIANTHUSTUBEROSUSL,屬菊科向日葵屬,又名洋姜、鬼子姜,是一種多年宿根性草本植物,菊芋高13米,有塊狀的地下莖及纖維狀根。菊芋抗逆性好,果聚糖含量高。因此從菊芋中發(fā)掘果聚糖合成酶基因以及對(duì)其功能的分析對(duì)菊芋的耐旱機(jī)理研究和耐旱遺傳改良具有重要意義。本實(shí)驗(yàn)以菊芋品種“青芋1號(hào)”為材料,分別克隆了果聚糖合成酶基因1SST和1FFT,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)這兩個(gè)基因在不同程度干旱脅迫處理下的表達(dá)進(jìn)行研究,并對(duì)1SST和1FFT進(jìn)行原核表達(dá),為下一步的轉(zhuǎn)基因奠定了基礎(chǔ)。具體結(jié)果如下1SST基因CDS長(zhǎng)1985BP,編碼659個(gè)氨基酸,分子量為7459KD,等電點(diǎn)為510,蛋白質(zhì)半衰期為72小時(shí),為穩(wěn)定性蛋白,總平均親水性為0171,屬于親水性蛋白。序列同源性比對(duì)表明,菊芋1SST與朝鮮薊、萵苣和菜薊等菊科作物的同源性分別為84%、83%、83%。進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果表明菊芋1SST與朝鮮薊1SST遺傳距離最近。1FFT基因CDS長(zhǎng)2025BP,編碼641個(gè)氨基酸,分子量為73802KD,等電點(diǎn)為1001,不穩(wěn)定系數(shù)為4608,屬于不穩(wěn)定蛋白,總平均親水性為0153表明1FFT蛋白屬于親水性蛋白。序列同源性比對(duì)表明表明,菊芋1FFT與維氏菊的同源性最高,為85%,進(jìn)化樹(shù)分析顯示菊芋1FFT與維氏菊1FFT遺傳距離最近。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示1SST和1FFT在菊芋葉片、莖段、根、花及塊莖中均有表達(dá),但在不同組織中的表達(dá)水平有顯著差異,1SST和1FFT基因在塊莖中的表達(dá)量最高。利用PEG6000模擬脅迫,結(jié)果表明,1SST基因和在1FFT基因不同脅迫時(shí)間均有表達(dá),并存在顯著性差異,其中1SST基因在48H時(shí)表達(dá)量最高,1FFT基因在60H時(shí)表達(dá)量最高。以PET30A為原核表達(dá)載體,分別與1SST和1FFT基因重組構(gòu)建了融合表達(dá)載體,轉(zhuǎn)入大腸桿菌,進(jìn)行誘導(dǎo)融合蛋白表達(dá),結(jié)果表明1SST和1FFT均能在原核表達(dá)體系中正常表達(dá)。
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- 關(guān) 鍵 詞:
- 菊芋 原核表達(dá) 耐旱機(jī)理 果聚糖 合成酶 基因克隆
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菊芋(Helianthus tuberosusL.),屬菊科向日葵屬,又名洋姜、鬼子姜,是一種多年宿根性草本植物,菊芋高1-3米,有塊狀的地下莖及纖維狀根。菊芋抗逆性好,果聚糖含量高。因此從菊芋中發(fā)掘果聚糖合成酶基因以及對(duì)其功能的分析對(duì)菊芋的耐旱機(jī)理研究和耐旱遺傳改良具有重要意義。本實(shí)驗(yàn)以菊芋品種“青芋1號(hào)”為材料,分別克隆了果聚糖合成酶基因1-SST和1-FFT,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)這兩個(gè)基因在不同程度干旱脅迫處理下的表達(dá)進(jìn)行研究,并對(duì)1-SST和1-FFT進(jìn)行原核表達(dá),為下一步的轉(zhuǎn)基因奠定了基礎(chǔ)。具體結(jié)果如下:
1-SST基因CDS長(zhǎng)1985bp,編碼659個(gè)氨基酸,分子量為74.59kD,等電點(diǎn)為5.10,蛋白質(zhì)半衰期為7.2小時(shí),為穩(wěn)定性蛋白,總平均親水性為-0.171,屬于親水性蛋白。序列同源性比對(duì)表明,菊芋1-SST與朝鮮薊、萵苣和菜薊等菊科作物的同源性分別為84%、83%、83%。進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果表明菊芋1-SST與朝鮮薊1-SST遺傳距離最近。
1-FFT基因CDS長(zhǎng)2025bp,編碼641個(gè)氨基酸,分子量為73.802kD,等電點(diǎn)為10.01,不穩(wěn)定系數(shù)為46.08,屬于不穩(wěn)定蛋白,總平均親水性為-0.153表明1-FFT蛋白屬于親水性蛋白。序列同源性比對(duì)表明表明,菊芋1-FFT與維氏菊的同源性最高,為85%,進(jìn)化樹(shù)分析顯示菊芋1-FFT與維氏菊1-FFT遺傳距離最近。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示:1-SST和1-FFT在菊芋葉片、莖段、根、花及塊莖中均有表達(dá),但在不同組織中的表達(dá)水平有顯著差異,1-SST和1-FFT基因在塊莖中的表達(dá)量最高。利用PEG6000模擬脅迫,結(jié)果表明,1-SST基因和在1-FFT基因不同脅迫時(shí)間均有表達(dá),并存在顯著性差異,其中1-SST基因在48h時(shí)表達(dá)量最高,1-FFT基因在60h時(shí)表達(dá)量最高。
以pET30a為原核表達(dá)載體,分別與1-SST和1-FFT基因重組構(gòu)建了融合表達(dá)載體,轉(zhuǎn)入大腸桿菌,進(jìn)行誘導(dǎo)融合蛋白表達(dá),結(jié)果表明1-SST和1-FFT均能在原核表達(dá)體系中正常表達(dá)。
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