29761.基于18srrna、16srrna、coⅰ、coⅱ基因的蝗總科系統(tǒng)發(fā)育研究

1、河北大學(xué)碩士學(xué)位論文基于18SrRNA、16SrRNA、COⅠ、COⅡ基因的蝗總科系統(tǒng)發(fā)育研究姓名：徐淼洋申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：動(dòng)物學(xué)指導(dǎo)教師：張道川印紅20090501捅要曼皇曼曼皇曼鼉皇曼曼皇皇量————————I—II———II——I曼!曼!蘭曼曼曼曼曼含量最高，達(dá)558％，這說(shuō)明密碼子的堿基使用頻率存在明顯的偏向性，在氨基酸組成上：不含半胱氨酸(Cys)和色氨酸(Trp)，含量最多的是亮氨酸(Leu)和蘇氨酸(Thr)；反映出

2、COI、COII基因在氨基酸組成上具一定的偏向性。2核酸序列的堿基變異和編碼蛋白基因的飽和度分析：18SrRNA基因序列轉(zhuǎn)換大于顛換，R(轉(zhuǎn)換／顛換)值為I3；16SrRNA基因序列顛換大于轉(zhuǎn)換，R值為O8；COI基因序列轉(zhuǎn)換與顛換比值總體為08，核苷酸替換主要發(fā)生在密碼子第3位點(diǎn)上，且顛換高于轉(zhuǎn)換，R值為O5，在遺傳距離02時(shí)，TV(顛換)超過(guò)了TS(轉(zhuǎn)換)，TS、TV與遺傳距離之間有很好的線性關(guān)系，均呈上升趨勢(shì)，未達(dá)到飽和；COII

3、基因序列轉(zhuǎn)換與顛換比值總體為O7，核苷酸替換主要發(fā)生在密碼子第3位點(diǎn)上，且顛換高于轉(zhuǎn)換，R值為06，在遺傳距離02時(shí)，TV超過(guò)了TS，Tv與遺傳距離之間有很好的線性關(guān)系，呈上升趨勢(shì)，未達(dá)飽和，但TS隨著P距離的增大逐漸趨于穩(wěn)定，已達(dá)飽和。3蝗總科遺傳距離比較：通過(guò)對(duì)蝗總科8個(gè)科10種昆蟲(chóng)的18SrRNA、16SrRNA、COI、COII基因序列進(jìn)行比對(duì)分析得出：蝗總科科間遺傳距離分別為：0000“0023，0048“0235，O125“

4、0254，0095t0298；與外群螻蛄總科(Gryllotalpoidea)東方螻蛄(Gryllotalpaoriental&)的遺傳距離分別為：0089“0099，0307“0377，0279～0355，0379“0444。4系統(tǒng)發(fā)育重建結(jié)果分析：采用MEGA軟件和PHYLIP軟件分別利用蝗總科8個(gè)科10種昆蟲(chóng)的18SrRNA、16SrRNA、COI、COII基因序列和對(duì)4條DNA序列進(jìn)行整合的序列構(gòu)建NJ系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，都能夠得到較為

5、一致的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，外群螻蛄總科東方螻蛄首先從樹(shù)的根部與蝗總科10種昆蟲(chóng)完全分離開(kāi)來(lái)，蝗總科的昆蟲(chóng)以較高的置信度聚在一起；錐頭蝗科和瘤錐蝗科以較高的置信度聚在一起，置于系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)根部，構(gòu)成了蝗總科的原始類群；癩蝗科與斑腿蝗科、斑翅蝗科、網(wǎng)翅蝗科、棒角蝗科和劍角蝗科以較高的置信度聚一起；斑翅蝗科的亞洲小車蝗(Oedaleusasiaticus)和亞洲飛蝗(Locustamigratoriamigratoria)以較高的置信度聚為一支；而斑腿