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1、中國海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文我國東黃海鰣魚自然群體的遺傳多樣性研究姓名:郭天慧申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):水生生物學(xué)指導(dǎo)教師:喻子??讜澡?002.6.6我國東黃海鯉魚自然群體的遺傳多樣性研究(二)線粒體DNAcytb基因序列多態(tài)性分析:從上述的3個鯤魚群體一、二、三中分別取15、16、15個個體,經(jīng)PCR擴(kuò)增、測序,得到長度為420bp的cytb基因片段的核苷酸序列。在總?cè)后w中共檢測到24個多態(tài)性核苷酸位點,歸為29種單倍型。其中,群體一、二
2、、三擁有的多態(tài)位點數(shù)和單倍型分別為16和12,14和12,12和13。在多態(tài)位點數(shù)S、平均核苷酸差異數(shù)K和核苷酸多樣性指數(shù)Pi三個指標(biāo)上,群體~的值相對較高,這表明3個群體中以群體一的遺傳多樣性最高,其余兩個群體次之。三個群體間的遺傳距離在00060007之間,沒有明顯的群體分化,分子系統(tǒng)樹也表明我國東黃海海域的鯤魚自然群體未出現(xiàn)明顯的地理遺傳分化,屬于同一個母系祖先,這與RAPD的分析結(jié)果相一致。另外,通過生物信息學(xué)的方法,初步分析了
3、鯡形目魚類莎瑙魚屬、黍鯡屬、鯡屬、小沙丁魚屬、沙丁魚屬、鰓屬等6個屑,15種的cytb基因片段的分子進(jìn)化系統(tǒng)。結(jié)果表明,鯡形目魚類這6個屬15種的cytb基因片段的分子系統(tǒng)樹與傳統(tǒng)分類學(xué)基本相一致。關(guān)鍵詞:鯤魚;遺傳多樣性:RAPD;線粒體DNA;cytb基因GenetiCDiversityStudieSinNatureJPopuJatiODSofEngrauIisjaponicusofDongHaiandYeIIOWSeaAbstra
4、ct:GeneticdiversityinthreenaturalpopuIationsoff諺a“l(fā)isjaponicuscoI|ectedfromOUrseaareaofDongHaiandYelIowSeawasanaIyzedbyusingRAPDtechniqueandDNAsequeRceTherandomlyamplifiedpolymorphicDNA(RAPD)techniquehasbecomeapowerfuige
5、neticmarkerforestimatingpolymorphismwithinspeciesandpopulationsThetechniqueWaSusedtoexaminegeneticdiversityinEngraulisjaponicusfromthethreepopulationsInitially,10oligonucleotideprimers(S101一S140;Sangon,Canada)werescreene
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