SLA復(fù)合體的微衛(wèi)星遺傳多樣性及與免疫性狀的關(guān)聯(lián).pdf

1、本試驗選用SLA復(fù)合體區(qū)域17個微衛(wèi)星位點，探究了豬地方群體遺傳多態(tài)性，包括萊蕪豬、藍(lán)塘豬、小梅山豬、寧鄉(xiāng)豬、淮南豬、圩豬和陸川豬7個品種;并篩選了12對微衛(wèi)星引物對杜洛克×二花臉F2資源群體進(jìn)行了多態(tài)性檢測，且與80天血液免疫指標(biāo)做的關(guān)聯(lián)分析，通過計算等位基因數(shù)、遺傳雜合度和多態(tài)信息含量等指標(biāo)來衡量群體內(nèi)SLA的遺傳多態(tài)性，并運(yùn)用遺傳的距離和群體的結(jié)構(gòu)等分析了群體間的遺傳變異，利用R語言GLM模型與免疫指標(biāo)做了關(guān)聯(lián)分析，結(jié)果如下:

2、r>　　 1.共檢測了7個地方豬品種SLA復(fù)合體內(nèi)17個微衛(wèi)星座位一共228個個體的遺傳多樣性。在總體群中總計檢測到了73個等位基因，7個地方品種所有座位平均10.18個等位基因，7個地方品種每個座位平均4.82個。
　　 2.發(fā)現(xiàn)了萊蕪豬中SLAMS034、SLAMS045和SLAMS056三個座位多態(tài)性較低，小梅山豬中SLAMS016、SLAMS034和SLAMS035多態(tài)性較低，寧鄉(xiāng)豬中SLAMS056多態(tài)性較低，淮南豬

3、中SLAMS052和SLAMS098兩個座位多態(tài)性較低以及圩豬中SLAMS056多態(tài)性較低，其余座位均表現(xiàn)較好的多態(tài)性。從7個群體水平總體來看，觀測雜合度(Ho)在0.125(SLAMS034)～0.906(SLAMS013)之間，期望雜合度(He)在0.173(SLAMS059)～0.875(SLAMS018)之間，多態(tài)信息含量(PIC)處于0.155(SLAMS059)～0.854(SLAMS018)之間。小梅山中SLAMS013和

4、SLAMS098均純合。5個群體的中、低度多態(tài)微衛(wèi)星分別為SLAMS045、SLAMS056和SLAMS098(藍(lán)塘豬除外);高度多態(tài)座位分別為SLAMS005、SLAMS013（小梅山除外）、SLAMS018、 SLAMS043和SLAMS052。
　　 3.F-統(tǒng)計結(jié)果可知，7個地方豬群體之間遺傳分化還是比較大的，群體間引起的遺傳變異占22.9％，而各群體內(nèi)個體間的差異引起的遺傳變異則是77.1％。運(yùn)用基于遺傳距離的聚類分析

5、與群體遺傳結(jié)構(gòu)指標(biāo)分析了7個地方豬品種的遺傳結(jié)構(gòu)，兩方面得出的結(jié)論趨于一致。兩種不同的分析方法都將7個地方豬品種按以下劃分:圩豬與陸川豬首先聚為一類，其次可與淮南、寧鄉(xiāng)豬聚為一類;萊蕪與藍(lán)塘豬聚為一類，小梅山豬聚為另一類。
　　 4.在杜洛克×二花臉雜交F2資源群體中檢測了12個微衛(wèi)星座位的等位基因，計算了各座位的等位基因數(shù)和等位基因頻率，獲得了其各位點的雜合度，多態(tài)信息含量，發(fā)現(xiàn)它們在此資源群體內(nèi)具有較為豐富的多態(tài)性;另外，將

6、SLAⅠ、Ⅱ經(jīng)典基因附近多態(tài)信息較好的位點在資源群體與地方豬群體間作了對比，在SLAⅠ類區(qū)域，地方豬的PIC較高(0.537)，雜交品種為(0.496);但在SLAⅡ區(qū)，雜交品種的較高0.62，地方豬為0.53。
　　 5.分析SLA微衛(wèi)星座位與杜洛克×二花臉雜交F2資源群體豬（392頭）與80天血液免疫指標(biāo)的關(guān)系。結(jié)果表明，所選擇12個微衛(wèi)星座位中，SLAMS035與80D_blood_parameter(80D)-BA顯著相

7、關(guān)（P為0.040），SLAMS034與80D-BA％顯著相關(guān)（P為0.026），SLAMS050與80D-PDW顯著相關(guān)（P為0.045），SLAMS013與80D-MPV、80D-NE％顯著相關(guān)（P分別為0.025，0.037）及與80D-PLT極顯著相關(guān)（P為0.006），SLAMS056與80D-BA％、80D-HCT、80D-HGB顯著相關(guān)（P分別為0.022，0.011，0.027），SLAMS048與80D-LY％、80D