淮河流域日本沼蝦野生群體分子遺傳多樣性及系統(tǒng)演化分析.pdf

1、日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)是我國(guó)最重要的淡水經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖蝦類,淮河流域是我國(guó)日本沼蝦種質(zhì)資源分布較多的主要區(qū)域之一。近20年來,淮河流域日本沼蝦由于過度捕撈及長(zhǎng)期環(huán)境惡化等原因出現(xiàn)了種質(zhì)資源衰退現(xiàn)象,本研究,利用微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)和線粒體COI序列變異分析了淮河流域17個(gè)日本沼蝦野生群體(半崗、城東湖、正陽關(guān)、焦崗湖、花家湖、瓦埠湖、高塘湖、芡河、天河、花園湖、五河、女山湖、老子山、金湖、界首、高郵、邵伯

2、湖)的種質(zhì)資源遺傳多樣性和系統(tǒng)演化,為淮河流域日本沼蝦種質(zhì)保護(hù)、資源利用和良種選育等提供基礎(chǔ)資料。主要內(nèi)容如下:
　　1.淮河流域日本沼蝦野生群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析
　　利用13對(duì)中高多態(tài)性的微衛(wèi)星引物分析了淮河流域日本沼蝦野生群體的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性。結(jié)果表明:17個(gè)群體中共有192個(gè)位點(diǎn)經(jīng)Bonferroni校正后顯示雜合不足且顯著偏離Hardy-Weinberg平衡;群體平均期望雜合度均小于0.716,顯示出較低

3、的遺傳多樣性水平,其中女山湖、邵伯湖群體遺傳多樣性相對(duì)較高,正陽關(guān)、高塘湖群體相對(duì)較低;淮河日本沼蝦群體偏離了突變-漂移平衡,呈現(xiàn)出遺傳多樣性下降的趨勢(shì),說明群體即將或曾經(jīng)經(jīng)歷瓶頸效應(yīng);群體間AMOVA分析表明,群體間遺傳分化程度較低,淮河日本沼蝦分化形成了中游和下游2個(gè)大類群,中游安徽段沒有形成顯著的遺傳結(jié)構(gòu),在種質(zhì)資源保護(hù)和管理上可將安徽段種群視作一個(gè)單元,這為日本沼蝦種質(zhì)資源保護(hù)和合理開發(fā)利用提供了基礎(chǔ)資料。
　　測(cè)定了淮河

4、流域17個(gè)日本沼蝦野生群體共248個(gè)個(gè)體的線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基I(COI)部分序列,獲得623 bp核苷酸片段,包括48個(gè)變異位點(diǎn),定義了31個(gè)單倍型,共享單倍型有12個(gè),整體單倍型多樣性和平均核苷酸多樣性均處于中間水平。AMOVA分析表明,17個(gè)群體間的遺傳分化系數(shù)FST=0.0413(P<0.05),群體間遺傳分化較小。Kimura2-paramter遺傳距離在五河和焦崗湖、花家湖及瓦埠湖群體間最大為0.014,在高郵和卲伯湖群