斜帶石斑魚野生和養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析.pdf

1、本研究以海南近海斜帶石斑魚野生和養(yǎng)殖群體作為研究對(duì)象,采用SSR和AFLP兩種分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)其群體遺傳多樣性進(jìn)行調(diào)查,評(píng)估其種質(zhì)資源狀況。為斜帶石斑魚種質(zhì)資源保護(hù)和良種培育提供理論依據(jù)。研究結(jié)果如下:
　　 1.利用斜帶石斑魚近緣種微衛(wèi)星序列建立了適合斜帶石斑魚的微衛(wèi)星標(biāo)記體系,研究了斜帶石斑魚野生群體和養(yǎng)殖群體在19個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)上的遺傳變異情況。其中,15個(gè)位點(diǎn)具有多態(tài),多態(tài)比率為78.95％。19個(gè)位點(diǎn)共檢測(cè)到75個(gè)等位基因

2、,平均每個(gè)引物獲得3.95個(gè)等位基因。19個(gè)位點(diǎn)中養(yǎng)殖群體和野生群體的等位基因(na)平均數(shù)為3.1053和3.9474;每個(gè)基因座位上有效等位基因(ne)的平均數(shù)分別為2.1677和2.5338;香儂信息指數(shù)(Ⅰ)平均數(shù)分別為0.7235和0.8963;兩群體觀測(cè)雜合度(Ho)平均數(shù)分別為0.6875和0.7061;兩群體期望雜合度(He)平均數(shù)分別為0.4215和0.4803;兩群體間的遺傳相似系數(shù)為0.9794,遺傳距離為0.02

3、08;遺傳分化系數(shù)Fst平均值為0.0157,結(jié)果表明兩群體間的遺傳分化較小;野生群體遺傳多態(tài)性比養(yǎng)殖群體高;斜帶石斑魚野生和養(yǎng)殖群體遺傳多樣性均比較豐富。
　　 2.采用9對(duì)選擇性擴(kuò)增引物對(duì)斜帶石斑魚野生和養(yǎng)殖群體遺傳變異進(jìn)行AFLP分析,共檢測(cè)到500個(gè)位點(diǎn)。擴(kuò)增位點(diǎn)片段分布在67～500bp范圍內(nèi),多態(tài)位點(diǎn)為421個(gè),多態(tài)位點(diǎn)比例為84.20％;有76個(gè)位點(diǎn)是兩群體所共有的100％顯性位點(diǎn),占總位點(diǎn)的15.20％,有126

4、個(gè)位點(diǎn)在養(yǎng)殖群體中為全隱,而在野生群體中有顯性個(gè)體存在,占總位點(diǎn)的25.2％;平均每對(duì)引物擴(kuò)增出55.6個(gè)位點(diǎn);斜帶石斑魚養(yǎng)殖群體和野生群體等位基因平均數(shù)分別為1.3520和1.8320;有效等位基因平均數(shù)分別為1.1878和1.4166;基因多樣性系數(shù)分別為0.1114和0.2449;香儂信息指數(shù)分別為0.1689和0.3726。野生群體所有多樣性指數(shù)均高于養(yǎng)殖群體,說(shuō)明野生群體遺傳多態(tài)性較養(yǎng)殖群體豐富,兩群體的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離

5、分別為0.9435和0.0582,遺傳多樣性指數(shù)(Ht)為0.2036,居群內(nèi)的遺傳多樣性指數(shù)(Hs)為0.1782,兩群體間的的遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.1250,群體間的基因流動(dòng)系數(shù)為3.4997。說(shuō)明兩群體的總遺傳變異主要來(lái)自于居群內(nèi)個(gè)體間。
　　 SSR和AFLP兩種分子標(biāo)記的分析結(jié)果均表明:斜帶石斑魚野生群體多態(tài)性稍高于養(yǎng)殖群體;兩群體間遺傳分化較小,群體總遺傳變異主要來(lái)自于居群個(gè)體間;與其它魚類及同屬魚類遺傳多樣性