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文檔簡介
1、我國西南地區(qū)山羊品種資源豐富,其經濟價值顯著。為解決傳統(tǒng)選育方法存在的不足之處,本研究在傳統(tǒng)方法的基礎上加入分子標記輔助篩選,選用PRND、MAPK3、NPY和NPY-Y1R基因為候選基因,分析其在西南地區(qū)10個具有代表性的山羊品種中的多態(tài)性及其與繁殖性能之間的關系。為篩選山羊高繁殖力的標記基因提供科學依據(jù)。
根據(jù)綿羊PRND基因的mRNA序列和牛PRND基因的DNA序列設計6對引物,采用單鏈構象多態(tài)性(SSCP)方法檢測PR
2、ND基因在9個本土山羊品種和波爾山羊中的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)。其中3對引物(P1、P2和P4)檢測出兩組共6種基因型(分別定義為AA、AB和BB,以及CC、CD和DD)。實驗表明8個核苷酸位點存在突變。其中,G793A、C806T、G874C、T894C、T940G和G944A位于3’端區(qū)域;T28C為沉默突變,而A151G導致一個T51A氨基酸改變。另外,突變T28C和
3、A151G是完全連鎖的。在古藺馬羊、川東白山羊和貴州白山羊中,群體產羔數(shù)和個體初生重最小二乘值與PRND基因型均沒有顯著差異(P>0.05)。
參考牛的NPY-Y1R基因序列設計4對引物(P1~P4),采用SSCP檢測NPY-Y1R基因在9個本土山羊品種和波爾山羊中的SNPs。發(fā)現(xiàn)僅引物P4的擴增片段具有多態(tài)性。P4在10個山羊品種中共檢測出AA、AB、BB和AC四種基因型,但未能發(fā)現(xiàn)CC基因型。測序結果顯示B等位基因與A等位
4、基因相比在6174堿基處發(fā)生了C→T的單堿基突變,C等位基因相對于A等位基因在6189處堿基存在C→T的單堿基突變。AB基因型在貴州白山羊和川東白山羊兩個群體中產羔數(shù)都顯著高于AA基因型(P<0.05),而在古藺馬羊、貴州白山羊和川東白山羊三個群體中AA型和AB型之間的初生重最小二乘均值沒有顯著差異(P>0.05)。本研究初步表明,NPY-Y1R基因可能是影響山羊產羔數(shù)性狀的一個主效基因,C6174T單堿基突變也有可能作為篩選山羊產羔數(shù)
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