中國(guó)栽培稻的遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、中國(guó)是亞洲栽培稻的起源中心之一,經(jīng)過長(zhǎng)期的自然選擇和人工馴化,形成了豐富的稻種資源。本研究選用程氏指數(shù)法和均勻分布在水稻12條染色體上的84個(gè)SSR標(biāo)記對(duì)中國(guó)栽培稻的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性進(jìn)行分析,旨在闡明中國(guó)栽培稻遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳變異特點(diǎn)。主要研究結(jié)果如下:
　　 1.選取已明確類型的100份亞洲栽培稻品種,分別應(yīng)用程氏指數(shù)6性狀和84個(gè)SSR標(biāo)記對(duì)其進(jìn)行比較分析。結(jié)果表明,程氏指數(shù)和SSR標(biāo)記對(duì)等位酶Ⅰ群(典型秈稻)和Ⅵ-A群(

2、溫帶粳稻)劃分的亞結(jié)構(gòu)特征均十分明顯,且吻合度較高(86.7-93.3％)。Mantel檢測(cè)揭示,采用程氏指數(shù)6性狀與SSR標(biāo)記對(duì)亞洲栽培稻分類存在明顯的正相關(guān),應(yīng)用兩種不同的方法計(jì)算得到的各個(gè)材料間的遺傳距離的相關(guān)系數(shù)達(dá)到極顯著水平(r=0.466,P≤0.01)。遺傳結(jié)構(gòu)和聚類分析表明,在秈粳亞種水平上,程氏指數(shù)法和SSR標(biāo)記分類結(jié)果趨于一致,但在亞種內(nèi)亞結(jié)構(gòu)分析中,程氏指數(shù)偏差較大,SSR標(biāo)記具有更高的準(zhǔn)確性。
　　 2.

3、基于模型和Nei無偏遺傳距離,將已明確類群的100份亞洲栽培稻品種分為6個(gè)類群,分別為Indica、Aus、Rayada、Aromatic、Tropical japonica和Temperate japonica。中國(guó)栽培稻品種以100份品種的6個(gè)類群為對(duì)照,基于Nei無偏遺傳距離進(jìn)行聚類分析,發(fā)現(xiàn)Indica和Temperate japonica、Tropical japonica是中國(guó)栽培稻資源的主要類群,并同時(shí)存在有Aus和Aro

4、matic類群,但在本研究中未發(fā)現(xiàn)Rayada類群品種。AMOVA分析表明,有23％的SSR遺傳變異來自類群間,且不同SSR位點(diǎn)在類群間的遺傳分化程度不同。
　　 3.采用84個(gè)SSR標(biāo)記對(duì)852份中國(guó)栽培稻品種的遺傳多樣性進(jìn)行分析,共檢測(cè)到1186個(gè)等位基因,各位點(diǎn)檢測(cè)到的等位基因數(shù)(Na)變幅為2-34,平均為14.1；Nei基因多樣性指數(shù)(He)變幅為0.464-0.950,平均為0.751；多態(tài)性信息量(PIC)變幅為0