七個(gè)中國海帶養(yǎng)殖群SRAP標(biāo)記的遺傳多樣性研究.pdf

1、海帶(Laminaria)是一種重要的大型經(jīng)濟(jì)海藻。目前,我國海帶栽培面積、栽培規(guī)模均居世界首位。海帶被廣泛應(yīng)用于食品、化工原料、海洋藥物等領(lǐng)域。海帶還是近海潮下帶初級(jí)生產(chǎn)力的重要組成部分,在調(diào)節(jié)海洋環(huán)境、維持生態(tài)平衡中發(fā)揮著積極作用。自海帶育種工作在我國開展以來,有關(guān)研究一直走在世界前列,并逐漸培育出一系列優(yōu)良品種。時(shí)代發(fā)展,單純的高產(chǎn)已不能滿足日益多樣化的行業(yè)需求,海帶品種培育面臨著從產(chǎn)量到品質(zhì)蛻變的挑戰(zhàn)。為解決這些問題,現(xiàn)代海帶栽

2、培業(yè)必須加強(qiáng)遺傳育種、種質(zhì)資源以及相應(yīng)分子生物學(xué)的研究,以豐富發(fā)展育種理論和技術(shù)方法。
　　 SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)標(biāo)記是一種基于PCR(polymerase chain reaction)的新型分子標(biāo)記技術(shù),該技術(shù)針對(duì)基因外顯子里GC含量豐富而啟動(dòng)子和內(nèi)含子里AT含量豐富的特點(diǎn)來設(shè)計(jì)引物,對(duì)開放閱讀框(ORFs)進(jìn)行擴(kuò)增。正向引物對(duì)外顯子進(jìn)行擴(kuò)增,反向引物對(duì)內(nèi)

3、含子、啟動(dòng)子進(jìn)行擴(kuò)增,因不同個(gè)體以及物種的內(nèi)含子、啟動(dòng)子和外顯子間隔長度不等而產(chǎn)生多態(tài)性。目前,SRAP標(biāo)記已經(jīng)廣泛應(yīng)用于許多物種遺傳圖譜的構(gòu)建、遺傳多樣性分析以及比較遺傳學(xué)中,SRAP標(biāo)記在藻類中應(yīng)用較少,僅有在紫菜中遺傳多樣性分析和遺傳圖譜構(gòu)建的相關(guān)報(bào)道。
　　 本研究利用SRAP標(biāo)記對(duì)七個(gè)我國的海帶養(yǎng)殖種群(共169個(gè)個(gè)體)進(jìn)行遺傳結(jié)構(gòu)分析,從88對(duì)引物組合中篩選出適用于海帶的15對(duì)SRAP引物組合,在100bp-900b

4、p之間共擴(kuò)增出246個(gè)位點(diǎn),其中226個(gè)位點(diǎn)具有多態(tài)性,平均每對(duì)引物擴(kuò)增16.40個(gè)位點(diǎn),平均多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)15.07個(gè)。七個(gè)群體的多態(tài)性位點(diǎn)比率(P)在54.07％～63.41％之間,平均多態(tài)性位點(diǎn)比率為57.67％；Nei's遺傳多樣性指數(shù)(H)在0.2003～0.2292之間,平均Nei's遺傳多樣性指數(shù)為0.2139；香農(nóng)指數(shù)(I)在0.2962～0.3406之間,平均香農(nóng)指數(shù)為0.3162；群體的遺傳多樣性水平較高,其中作為對(duì)照

5、的生產(chǎn)種遺傳多樣性水平最高,而榮福海帶的遺傳多樣性最低。在物種水平上(即對(duì)所有品系和種群來說),多態(tài)性位點(diǎn)比率(P)、Nei's遺傳多樣性指數(shù)(H)、香農(nóng)指數(shù)(I)分別是91.87％、0.3143、0.4691。以種群問的遺傳距離為基礎(chǔ),用非加權(quán)類平均法(UPGMA)構(gòu)建的系統(tǒng)樹圖清楚反映了群體間親緣關(guān)系。AMOVA分析顯示,在所有的遺傳變異中,38.48％來源于群體間,61.52％來源于群體內(nèi),群體間遺傳分化差異顯著(P<0.01)。