邊雞遺傳多樣性及Myostatin基因?qū)ιL和繁殖性狀的遺傳效應研究.pdf

1、本研究利用29個微衛(wèi)星標記研究邊雞0世代群體的遺傳多樣性，并與2個對照品種(京海黃雞和尤溪麻雞)的遺傳多樣性進行比較；選擇0世代邊雞群體中等位基因數(shù)在4個以上的21個微衛(wèi)星標記研究1世代邊雞群體的遺傳多樣性，并與0世代邊雞群體的遺傳多樣性進行比較以了解邊雞群體的保種效果；采用PCR-SSCP技術檢測邊雞及3個對照品種(京海黃雞、尤溪麻雞和AA雞)肌肉生長抑制素基因(Myostatin)的單核苷酸多態(tài)性，并與邊雞的生長和繁殖性狀進行相關分

2、析，為邊雞群體的標記輔助選擇提供依據(jù)；運用熒光定量PCR技術分析邊雞Myostatin基因G2283A位點形成的3種基因型在胸肌、腿肌和卵巢中表達量的差異，以探討這一位點對邊雞的生長性狀和繁殖性狀具有顯著效應的分子機理，同時分析邊雞Myostatin基因在胸肌、腿肌和卵巢中表達量的差異。主要研究結(jié)果如下：
　　 1.利用29個微衛(wèi)星標記在3個雞品種(邊雞、京海黃雞和尤溪麻雞)中總共檢測到166個等位基因，其中32個等位基因為某一

3、品種所特有。邊雞擁有的特有等位基因最多，為15個(46.9％)，京海黃雞次之，為12個(37.5％)。邊雞的平均多態(tài)信息含量(0.5168)和平均期望雜合度(0.5750)最高，京海黃雞的平均多態(tài)信息含量(0.4915)和平均期望雜合度最低(0.5505)。在29個微衛(wèi)星位點中，邊雞群體有15位點為高度多態(tài)位點，其余14個位點為中度多態(tài)位點。京海黃雞和尤溪麻雞的高度多態(tài)位點數(shù)分別為17和14個。在3個品種中一些位點顯著的偏離哈代-溫伯格

4、平衡，雜合子缺失的水平也很高。通過固定指數(shù)(Fst)估計品種間的遺傳分化為6.7％(P＜0.001)。群體內(nèi)的雜合子缺失(Fis)為22.2％(P＜0.001)。邊雞的近交系數(shù)最高(0.249)，京海黃雞的最低(0.159)。這些研究結(jié)果可為邊雞、京海黃雞以及尤溪麻雞的遺傳特征研究和保種提供初步依據(jù)。
　　 2.選用的等位基因數(shù)在4個以上的21個微衛(wèi)星標記在2個世代的邊雞群體中共檢測到122個等位基因，其中102個為兩個世代所共

5、有，19個為0世代所特有。0世代和1世代的邊雞群體的平均多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.5473和0.5437；平均期望雜合度分別(He)為0.5967和0.6009；近交系數(shù)(Fis)分別為0.233和0.134。經(jīng)過一個世代的繁育，PIC和He兩個指標維持在原有水平，而群體的近交系數(shù)有所下降，說明采用的保種方法很好的保存了邊雞的遺傳多樣性，同時避免了近交程度過高而導致群體出現(xiàn)近交衰退。
　　 3.在4個雞品種Myostati

6、n基因中總共檢測到17個突變，其中10個突變(A326G、C334G、G673A、G985C、G1085A、A1278T、C1346T、G1375A、A1473G和G1491A)位于5'調(diào)控區(qū)，4個突變(G2100A、G2109A、C2244G和G2283A)位于外顯子1，3個突變(C7552T，C7638T和T7661A)位于外顯子3。編碼區(qū)的突變都未導致氨基酸的改變。
　　 4.邊雞、京海黃雞、尤溪麻雞和AA雞Myostat

7、in基因中分別有7、9、9和5個位點表現(xiàn)出多態(tài)。邊雞MYOE1-2位點為高度多態(tài)位點，MYO1和MYOE1-3位點為中度多態(tài)位點，其余4個位點為低度多態(tài)位點。京海黃雞、尤溪麻雞和AA雞中高度多態(tài)位點數(shù)分別為1、2、0個，中度多態(tài)位點數(shù)都為4個。
　　 5.通過在線軟件預測發(fā)現(xiàn)4個雞品種Myostatin基因5'調(diào)控區(qū)的突變總共導致10個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(E2F、CRE-BP、CREB、HFH-2、NKx-2、CdxA、Oct-1

8、、V-Maf、Tst-1和C/EBPα)發(fā)生了改變。
　　 6.邊雞Myostatin基因5'調(diào)控區(qū)MYO1、MYO6和MYO7位點以及外顯子區(qū)MYOE1-2、MYOE1-3位點對邊雞的生長性狀具有顯著或極顯著的影響(P＜0.05或P＜0.01)，推測Myostatin基因可能是影響邊雞生長性狀的主效基因或與主效基因相連鎖的一個標記。MYOE1-3位點DE和EE基因型的6-18周齡體重都顯著或極顯著的高于EE基因型(P＜0.05

9、或P＜0.01)，并且具有EE基因型的體重＞DE基因型＞EE基因型的規(guī)律，MYOE1-3位點在邊雞生長性狀的標記輔助選擇方面具有很大的應用潛力。
　　 7.邊雞Myostatin基因5'調(diào)控區(qū)MYO1、MYO6和MYO7位點對邊雞的開產(chǎn)體重有顯著的影響(P＜0.05)，外顯子區(qū)MYOE1-2、MYOE1-3、MYOE3-2和MYOE3-3位點對邊雞的開產(chǎn)日齡和300日齡產(chǎn)蛋數(shù)具有顯著或極顯著的影響(P＜0.05或P＜0.01)，

10、推測Myostatin基因可能是影響邊雞繁殖性狀的的主效基因或與主效基因相連鎖的一個標記。MYOE1-3位點DE基因型的開產(chǎn)日齡顯著的早于DD基因型(P＜0.05)，EE基因型的開產(chǎn)日齡極顯著的早于DD基因型(P＜0.01)；MYOE1-3位點DE基因型的300日齡產(chǎn)蛋數(shù)顯著的高于DD基因型(P＜0.05)，EE基因型的300日齡產(chǎn)蛋數(shù)極顯著的高于DD基因型(P＜0.01)，MYOE1-3位點在邊雞300日齡產(chǎn)蛋數(shù)的標記輔助選擇方面具有

11、很大的應用潛力。
　　 8.邊雞Myostatin基因7個多態(tài)位點兩兩組合對邊雞的生長性狀和繁殖性狀的互作效應達到顯著(P＜0.05)或極顯著(P＜0.01)的水平。
　　 9.通過熒光定量PCR技術發(fā)現(xiàn)Myostatin基因G2283A位點形成的3種基因型(DD、DE和EE)在胸肌、腿肌中的表達量存在差異，在卵巢中的表達量沒有差異。在胸肌中，野生型(DD)的表達量是突變雜合型(DE)的表達量的1.40倍，是突變純合型(