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文檔簡(jiǎn)介
1、本研究以貴妃雞為試驗(yàn)素材,研究與雞蛋膽固醇含量調(diào)控相關(guān)候選基因Apo-Ⅱ基因、OVR基因和VTGⅡ基因的單鏈核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)及其與蛋黃膽固醇含量(Content of Cholesterol in eggyolk)之間的關(guān)系。
根據(jù)GenBank上的基因序列共設(shè)計(jì)11對(duì)引物,采用PCR-SSCP技術(shù),分別對(duì)貴妃雞Apo-Ⅱ基因的第2和第3外顯子、OVR
2、基因第1和第2外顯子、VTGⅡ基因第6、22、26、27、33、34、35外顯子進(jìn)行PCR擴(kuò)增,進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳并測(cè)序,篩查SNP位點(diǎn)分析其多態(tài)性;同時(shí)探討各調(diào)控基因與蛋黃膽固醇含量之間的相關(guān)性,從而為低膽固醇蛋雞品系的育種工作提供分子標(biāo)記。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn):
1、在Apo-Ⅱ基因的第2和第3外顯子、OVR基因的第1和第2外顯子均未發(fā)現(xiàn)多態(tài)位點(diǎn)。
2、VTGⅡ基因第6、22、27、34、35外顯子未找到多態(tài)位
3、點(diǎn)。第26、33外顯子共發(fā)現(xiàn)4個(gè)位點(diǎn)。分別為C13161T、A17698T、T17719G、G17764A。C13161T位點(diǎn)在實(shí)驗(yàn)群體中只檢測(cè)到CC和CT兩種基因型,該突變沒(méi)有引起氨基酸的變化。A17698T位點(diǎn)只檢測(cè)到TT和AT兩種基因型;該突變位于內(nèi)含子上。T17719G位點(diǎn)檢測(cè)到TT、TG、GG三種基因型;該突變導(dǎo)致色氨酸變?yōu)楦拾彼?。G17764A位點(diǎn)檢測(cè)到GG和GA兩種基因型;該突變導(dǎo)致谷氨酸變?yōu)橘嚢彼?。兩處突變均?duì)表達(dá)的蛋白
4、特性產(chǎn)生影響。
3、x2檢驗(yàn)表明,C13161T位點(diǎn)和A17698T處于Hardy-Weinberg平衡,T17719G和G17764A兩個(gè)位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg不平衡狀態(tài)。遺傳多態(tài)性分析表明,C13161T和A17698T位點(diǎn)處于低度多態(tài),T17719G和G17764A兩個(gè)位點(diǎn)處于中度多態(tài),其中G17764A位點(diǎn)的多態(tài)性最高,變異程度最大,存在較大的選擇潛力??傮w反映了該群體具有較為豐富的遺傳多樣性。
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